RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485692.1

GTF3C5-209, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-209ENST00000485692 FBXO8Q9NRD0 319 aa20.63■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 HACD3Q9P035 362 aa20.63■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC23A2Q9UGH3 650 aa20.63■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 PDZK1P1A8MUH7 402 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 HACD1B0YJ81 288 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 MTX2O75431 263 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 LCA5LO95447 670 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 VIPP01282 170 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SFTPCP11686 197 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 VCLP18206 1134 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 ADCY2Q08462 1091 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 C11orf63Q6NUN7 778 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SARM1Q6SZW1 724 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 PID1Q7Z2X4 250 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 CCDC50Q8IVM0 306 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF547Q8IVP9 402 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TC2NQ8N9U0 490 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 GDAP1Q8TB36 358 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 DTX3LQ8TDB6 740 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 BRSK1Q8TDC3 778 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 RTP4Q96DX8 246 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 FCRL5Q96RD9 977 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TRIM5Q9C035 493 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 BPIFA1Q9NP55 256 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 KLHL3Q9UH77 587 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 PILRAQ9UKJ1 303 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.62■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 PRR19A6NJB7 356 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 RAD1O60671 282 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 ANKRD34CP0C6C1 535 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 IDSP22304 550 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 CYP4F2P78329 520 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 GTF2H3Q13889 308 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SPA17Q15506 151 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TBR1Q16650 682 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 WASH2PQ6VEQ5 465 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF567Q8N184 647 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 MRGPRX2Q96LB1 330 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TTC25Q96NG3 672 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 IL26Q9NPH9 171 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 WASH6PQ9NQA3 447 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 POT1Q9NUX5 634 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.61■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 UBXN7O94888 489 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 LIFP15018 202 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 HLA-DPA1P20036 260 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SPAM1P38567 509 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC19A1P41440 591 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 MPP3Q13368 585 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC1A5Q15758 541 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 PPP2R5EQ16537 467 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 AGAP9Q5VTM2 703 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TTC30BQ8N4P2 665 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 HAUS1Q96CS2 278 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 CTRCQ99895 268 aa20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TENM4Q6N022 2769 aa20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 KCNJ13O60928 360 aa20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 PPFIA2O75334 1257 aa20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 C9P02748 559 aa20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 FAM87AP0C7U9 286 aa20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 RPL10P27635 214 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 CHRNA4P43681 627 aa20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 MARCKSL1P49006 195 aa20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 NFATC3Q12968 1075 aa20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 XRCC4Q13426 336 aa20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 NOMO1Q15155 1222 aa20.59■□□□□ 0.89
GTF3C5-209ENST00000485692 BBS12Q6ZW61 710 aa20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms