RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485623.5

ATG16L1-216, Transcript of autophagy related 16 like 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATG16L1, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1-216ENST00000485623 FDFT1P37268 417 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 CTSCP53634 463 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 INHBCP55103 352 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 NFATC2Q13469 925 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 SEMA5AQ13591 1074 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 RASGEF1CQ8N431 466 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 FGF11Q92914 225 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 LRRC45Q96CN5 670 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 TMEM74Q96NL1 305 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 JRKLQ9Y4A0 524 aa14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 A0A0G2JNG1 304 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 CDRT15L2A8MXV6 281 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 SGTAO43765 313 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 CEP104O60308 925 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 SNX2O60749 519 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 KCNJ13O60928 360 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 CPNE6O95741 557 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 IFNB1P01574 187 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 BRAFP15056 766 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 ACTN2P35609 894 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 HADHAP40939 763 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 GRIA1P42261 906 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 ERVPABLB-1P60509 514 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 DMPKQ09013 629 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 KIR2DS5Q14953 304 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 AMZ1Q400G9 498 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 AGAP9Q5VTM2 703 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 XKR5Q6UX68 686 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 USP53Q70EK8 1073 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 LINC00523Q86TU6 105 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 PIM3Q86V86 326 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 PRELID2Q8N945 189 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 OR52K1Q8NGK4 314 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 GDAP1Q8TB36 358 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 ASB8Q9H765 288 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 RDH14Q9HBH5 336 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 PDP2Q9P2J9 529 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 SCN8AQ9UQD0 1980 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 LAMA5O15230 3695 aa14.59□□□□□ -0.07
ATG16L1-216ENST00000485623 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 ZW10O43264 779 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 POP7O75817 140 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 SLC2A4P14672 509 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 SLC19A1P41440 591 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 TMPRSS15P98073 1019 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 HHEXQ03014 270 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 INSCQ1MX18 579 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 C3orf38Q5JPI3 329 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 SNX20Q7Z614 316 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 STYXQ8WUJ0 223 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 SGF29Q96ES7 293 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 TTC25Q96NG3 672 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 CASS4Q9NQ75 786 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 RAB6BQ9NRW1 208 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 PAK5Q9P286 719 aa14.58□□□□□ -0.08
ATG16L1-216ENST00000485623 CPNE7Q9UBL6 633 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms