RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.67□□□□□ -0.54
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RABGEF1-207ENST00000484547 EFHD1Q9BUP0 239 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-207ENST00000484547 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-207ENST00000484547 SPRY4Q9C004 299 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-207ENST00000484547 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-207ENST00000484547 APMAPQ9HDC9 416 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGEF1-207ENST00000484547 KCTD5Q9NXV2 234 aa11.67□□□□□ -0.54
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RABGEF1-207ENST00000484547 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa11.66□□□□□ -0.54
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RABGEF1-207ENST00000484547 SEPT6Q14141 434 aa11.65□□□□□ -0.54
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RABGEF1-207ENST00000484547 FAM114A2Q9NRY5 505 aa11.65□□□□□ -0.54
RABGEF1-207ENST00000484547 KLHL3Q9UH77 587 aa11.65□□□□□ -0.54
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RABGEF1-207ENST00000484547 TAS2R14Q9NYV8 317 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 NFU1Q9UMS0 254 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 MED13Q9UHV7 2174 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 GMNCA6NCL1 334 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-207ENST00000484547 K7EM74 188 aa11.63□□□□□ -0.55
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