RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482140.5

OPTN-210, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 667 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-210ENST00000482140 AKT1P31749 480 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 HADHAP40939 763 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ABCG1P45844 678 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 LMAN1P49257 510 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 CLCNKAP51800 687 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 SNX1Q13596 522 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 GPRC6AQ5T6X5 926 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 IYDQ6PHW0 289 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 USP53Q70EK8 1073 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ZNF248Q8NDW4 579 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 DDHD1Q8NEL9 900 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ZNF398Q8TD17 642 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 MAIP1Q8WWC4 291 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 C1orf54Q8WWF1 131 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ASB8Q9H765 288 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 PRDM8Q9NQV8 689 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 FKBPLQ9UIM3 349 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 LHX6Q9UPM6 363 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 KCTD3Q9Y597 815 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 FREM2Q5SZK8 3169 aa14.61□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 E7EVH7 732 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 AGRPO00253 132 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 GPR39O43194 453 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 SRP72O76094 671 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 TNFSF15O95150 251 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 AP2A1O95782 977 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 GAS8O95995 478 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 JMJD7P0C870 316 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 FDFT1P37268 417 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 GPLD1P80108 840 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 TMPRSS15P98073 1019 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 NFATC2Q13469 925 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 SEPT6Q14141 434 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 OASLQ15646 514 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 COL28A1Q2UY09 1125 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 KCTD11Q693B1 232 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 DENND5AQ6IQ26 1287 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 LINC00523Q86TU6 105 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 CCDC89Q8N998 374 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 OR10G6Q8NH81 332 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 TMEM159Q96B96 161 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 RTP4Q96DX8 246 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 CMKLR1Q99788 373 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 NUDT22Q9BRQ3 303 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 SMOXQ9NWM0 555 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 CRLS1Q9UJA2 301 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 LOXL2Q9Y4K0 774 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa14.6□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 PMS2P1A4D2B8 440 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 A6NCN8 305 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 DUX1O43812 170 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 KCNJ13O60928 360 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 VIPP01282 170 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ITGA2BP08514 1039 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 TPH1P17752 444 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ITGALP20701 1170 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 IDSP22304 550 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 CD1CP29017 333 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 MAPK9P45984 424 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 JAMLQ86YT9 394 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 SLITRK4Q8IW52 837 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 DNAAF3Q8N9W5 541 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 ULK4Q96C45 1275 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
OPTN-210ENST00000482140 SEMA6CQ9H3T2 930 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms