RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480447.5

NOP56-212, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 651 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-212ENST00000480447 SLC38A3Q99624 504 aa6.21□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 BPIFA3Q9BQP9 254 aa6.21□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 ADGRE3Q9BY15 652 aa6.21□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 UCK1Q9HA47 277 aa6.21□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 RDH14Q9HBH5 336 aa6.21□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 NOD2Q9HC29 1040 aa6.21□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.21□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.21□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.21□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 LRBAP50851 2863 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 MYO1FO00160 1098 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 MATN3O15232 486 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 KLF4O43474 513 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 MBD3O95983 291 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 PEX11BO96011 259 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 MT-ND3P03897 115 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 CCNCP24863 283 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 UGT1A3P35503 534 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 CASRP41180 1078 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 RGRP47804 291 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 CLCNKAP51800 687 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 HHEXQ03014 270 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 IL11RAQ14626 422 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 C16orf72Q14CZ0 275 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 PDK2Q15119 407 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 POU4F3Q15319 338 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 TCEA2Q15560 299 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 ASIC2Q16515 512 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 PYCR3Q53H96 274 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 FIGNQ5HY92 759 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 FBXW10Q5XX13 1052 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 IYDQ6PHW0 289 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 GK5Q6ZS86 529 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 Q6ZVL8 140 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 CHSY3Q70JA7 882 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 FAM129CQ86XR2 697 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 NAGSQ8N159 534 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 ESX1Q8N693 406 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 ART4Q93070 314 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 COX14Q96I36 57 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 TSGA13Q96PP4 275 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 NUDT22Q9BRQ3 303 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 SYT11Q9BT88 431 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 TRIM55Q9BYV6 548 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 ISCUQ9H1K1 167 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 KCND3Q9UK17 655 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 PILRAQ9UKJ1 303 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 KCTD3Q9Y597 815 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 RELNP78509 3460 aa6.2□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 NOTCH2Q04721 2471 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 CHD5Q8TDI0 1954 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 RP1P56715 2156 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 A0A0J9YYE9 177 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 FAM170AA1A519 330 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 KLHL33A6NCF5 533 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 EFCAB7A8K855 629 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 A8MX80 341 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 TMCO5BA8MYB1 307 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 PPM1DO15297 605 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 INPP4BO15327 924 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 VEGFDO43915 354 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 RAD1O60671 282 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 KCNJ13O60928 360 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 TRBC1P01850 177 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 KRT7P08729 469 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 ANKRD34CP0C6C1 535 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 IMPDH2P12268 514 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 CCL4P13236 92 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 GM2AP17900 193 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 VCLP18206 1134 aa6.19□□□□□ -1.42
NOP56-212ENST00000480447 ETV5P41161 510 aa6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms