RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 FAM96AQ9H5X1 160 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 MYLKQ15746 1914 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 IGF2RP11717 2491 aa20.64■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 B4GAT1O43505 415 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SNX2O60749 519 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 MC4RP32245 332 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 PDX1P52945 283 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 GNG11P61952 73 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 BASP1P80723 227 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SPIDRQ14159 915 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 INSCQ1MX18 579 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 MDM1Q8TC05 714 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 RANBP9Q96S59 729 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 NRSN2Q9GZP1 204 aa20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.896e-21■■■□□ 14.8
ACTB-211ENST00000480301 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 RHPN2P1A8MT19 583 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 KRT14P02533 472 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 F3P13726 295 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 MSH3P20585 1137 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ITGALP20701 1170 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ARSDP51689 593 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 OR1D5P58170 312 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 NXPE1Q8N323 547 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ULK4Q96C45 1275 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CRLS1Q9UJA2 301 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CCDC78A2IDD5 438 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 HEATR9A2RTY3 570 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 OR2AG2A6NM03 316 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 D6RAR5 112 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 POP7O75817 140 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 GAS8O95995 478 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 PRSS56P0CW18 603 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ADRA1DP25100 572 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 AKT1P31749 480 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 FASLGP48023 281 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CYP4F3Q08477 520 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 RTP5Q14D33 572 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 GPR33Q49SQ1 333 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 NAT14Q8WUY8 206 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SGF29Q96ES7 293 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 DKK4Q9UBT3 224 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 RIMKLBQ9ULI2 386 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SGTAO43765 313 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 KCNJ13O60928 360 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TPSB2P20231 275 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ALDH4A1P30038 563 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 GPR3P46089 330 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 GPS1Q13098 491 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TPSAB1Q15661 275 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TSTD2Q5T7W7 516 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZNF534Q76KX8 674 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 DET1Q7L5Y6 550 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 GRAMD1AQ96CP6 724 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ZNF778Q96MU6 729 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 KCND1Q9NSA2 647 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 UNC13CQ8NB66 2214 aa20.61■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 A0A0G2JNG1 304 aa20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
ACTB-211ENST00000480301 OR5K4A6NMS3 321 aa20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms