RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	AKAP13	Q12802	2813 aa		17.52	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	MROH6	A6NGR9	719 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	AP3B1	O00203	1094 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CHUK	O15111	745 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	OPA1	O60313	960 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	IGF2R	P11717	2491 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TPSB2	P20231	275 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CDK16	Q00536	496 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TPSAB1	Q15661	275 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902		Q8N9G6	341 aa	Predicted RBP	17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	PATE1	Q8WXA2	126 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SMOX	Q9NWM0	555 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	BFAR	Q9NZS9	450 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		17.51	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	OR2AG2	A6NM03	316 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RALB	P11234	206 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	GLB1	P16278	677 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	VCL	P18206	1134 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	NPY2R	P49146	381 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CRADD	P78560	199 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	GPR33	Q49SQ1	333 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	FNBP1L	Q5T0N5	605 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TMEM220	Q6QAJ8	160 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RANBP9	Q96S59	729 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		17.5	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CFAP99	D6REC4	459 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	PRSS56	P0CW18	603 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	MGAT1	P26572	445 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ARSD	P51689	593 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	PRAME	P78395	509 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CACNG1	Q06432	222 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	KCNJ11	Q14654	390 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	PCID2	Q5JVF3	399 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	NAGS	Q8N159	534 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	NXPE1	Q8N323	547 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ARL14	Q8N4G2	192 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	NAT14	Q8WUY8	206 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	HDAC10	Q969S8	669 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SGF29	Q96ES7	293 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	COPS8	Q99627	209 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	IL22	Q9GZX6	179 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RNF14	Q9UBS8	474 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		17.49	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	OR51F1	A6NGY5	319 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902		H7C0S8	307 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	FANCG	O15287	622 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	EML2	O95834	649 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	MT-CO3	P00414	261 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CTSC	P53634	463 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CASC4	Q6P4E1	433 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	AMZ2	Q86W34	360 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CPT1B	Q92523	772 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ZNF778	Q96MU6	729 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		17.48	■□□□□ 0.39

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