RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 DCDC1P59894 354 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 FOXK1P85037 733 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 AP1B1Q10567 949 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 LUZP1Q86V48 1076 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 LRRTM4Q86VH4 590 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 RASGRP3Q8IV61 690 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 TRAM1L1Q8N609 369 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 PLD5Q8N7P1 536 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 AGAP3Q96P47 875 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 TRIB3Q96RU7 358 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 GPR63Q9BZJ6 419 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 TRIM39Q9HCM9 518 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 TRIM10Q9UDY6 481 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.5□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 GPR89AB7ZAQ6 455 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 KMOO15229 486 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 KATNA1O75449 491 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 NDUFA10O95299 355 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 GYPCP04921 128 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 FURINP09958 794 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 GPR89BP0CG08 455 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 BRAFP15056 766 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 BPIP17213 487 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 KDELR1P24390 212 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 CAPZBP47756 277 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 CLCNKAP51800 687 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 UBASH3AP57075 661 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 TPM4P67936 248 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 MAP7Q14244 749 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 ERV3-1Q14264 604 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 GPR18Q14330 331 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 MESDQ14696 234 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 IRGCQ6NXR0 463 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 NPNTQ6UXI9 565 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 FAM92BQ6ZTR7 304 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 CXorf40BQ96DE9 158 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 RNF157Q96PX1 679 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 TIMM29Q9BSF4 260 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 UCK1Q9HA47 277 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 CBX8Q9HC52 389 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 POT1Q9NUX5 634 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 CAPN11Q9UMQ6 739 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 NENFQ9UMX5 172 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 PLAAQ9Y263 795 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 KCTD3Q9Y597 815 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa11.49□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 TEX15Q9BXT5 2789 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 CDC14CA4D256 554 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 K7EM74 188 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 APOL1O14791 398 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 CHUKO15111 745 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 CDK14O94921 469 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 H2AFZP0C0S5 128 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 PPP1CAP62136 330 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 DYNLT1P63172 113 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 CACHD1Q5VU97 1274 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 H2AFVQ71UI9 128 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 TMEM135Q86UB9 458 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 NT5DC3Q86UY8 548 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 ZNF547Q8IVP9 402 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 GDAP1Q8TB36 358 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 MAGEE1Q9HCI5 957 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 BPIFA1Q9NP55 256 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 UBP1Q9NZI7 540 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 SPO11Q9Y5K1 396 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 KCNMB2Q9Y691 235 aa11.48□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 SYCE3A1L190 88 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 MKRN2OSH3BPM6 223 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 AURKAO14965 403 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 GPR39O43194 453 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 MTSS1O43312 755 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 VEGFDO43915 354 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 PMPCBO75439 489 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 TIAF1O95411 115 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 KRT1P04264 644 aa11.47□□□□□ -0.57
GARNL3-210ENST00000453030 IDSP22304 550 aa11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms