RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438490.2

RALGAPB-204, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, human

TSL 5

Gene RALGAPB, Length 4,075 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RALGAPB-204	ENST00000438490	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	FUNDC1	Q8IVP5	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MIER2	Q8N344	545 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ATAD1	Q8NBU5	361 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MTRR	Q9UBK8	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PHF24	Q9UPV7	400 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490		A6NCN8	305 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ENO4	A6NNW6	628 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARVCF	O00192	962 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GIPC1	O14908	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	VPS26A	O75436	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	NDUFS3	O75489	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GNRH1	P01148	92 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	UROS	P10746	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	UMPS	P11172	480 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CD1E	P15812	388 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TTPA	P49638	278 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PGGT1B	P53609	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CLC	Q05315	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	OR4D1	Q15615	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CRY1	Q16526	586 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TTC23L	Q6PF05	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PAOX	Q6QHF9	649 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SPATA24	Q86W54	205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PHC3	Q8NDX5	983 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	OR2T3	Q8NH03	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MOCOS	Q96EN8	888 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SH3GL3	Q99963	347 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	AIG1	Q9NVV5	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SRRD	Q9UH36	339 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490		A0A1B0GVM2	712 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	TRPA1	O75762	1119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PRL	P01236	227 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	GPI	P06744	558 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	RHOC	P08134	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ALDOC	P09972	364 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	FCGR1A	P12314	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CSNK1D	P48730	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PTPN5	P54829	565 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SH3BP2	P78314	561 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PTRH1	Q86Y79	214 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ABI1	Q8IZP0	508 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SLC39A7	Q92504	469 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	SEPT8	Q92599	483 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RALGAPB-204	ENST00000438490	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms