RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1W2PQF6 199 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SLCO1B7G3V0H7 640 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 MID1O15344 667 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 OR1I1O60431 355 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 EDF1O60869 148 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 MMP20O60882 483 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ADAM23O75077 832 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SMIM24O75264 130 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PCDH8O95206 1070 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CD1DP15813 335 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 DRD4P21917 467 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 DRD3P35462 400 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ETV3P41162 512 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 GPR1P46091 355 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CLCN7P51798 805 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SEC24CP53992 1094 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SEC13P55735 322 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CSHL1Q14406 222 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 LIPMQ5VYY2 423 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PAQR3Q6TCH7 311 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SYT13Q7L8C5 426 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 OTOAQ7RTW8 1153 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 FAM174AQ8TBP5 190 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 GANCQ8TET4 914 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 KCTD4Q8WVF5 259 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ASZ1Q8WWH4 475 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 NUS1Q96E22 293 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CNDP1Q96KN2 507 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 NDNQ99608 321 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 GPR21Q99679 349 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 IER2Q9BTL4 223 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TRMOQ9BU70 441 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM54Q9BYV2 358 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SGK2Q9HBY8 427 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 EMCNQ9ULC0 261 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PLXNA2O75051 1894 aa9.5□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 COL4A3Q01955 1670 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 NUMA1Q14980 2115 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC72A6NJI9 287 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 G3V2L1 256 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 EBAG9O00559 213 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SLC16A5O15375 505 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 NPHS1O60500 1241 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 IPO13O94829 963 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM16O95361 564 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ASGR2P07307 311 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 MPC1LP0DKB6 136 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CHRNB1P11230 501 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 C6P13671 934 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TFEBP19484 476 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 IMPDH1P20839 514 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TRIM23P36406 574 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 WASP42768 502 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ABCG1P45844 678 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 NFKB2Q00653 900 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 GTF2H3Q13889 308 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TECRLQ5HYJ1 363 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CTSL3PQ5NE16 218 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 AGBL4Q5VU57 503 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PNCKQ6P2M8 343 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 C16orf46Q6P387 395 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 TMEM207Q6UWW9 146 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 LRRC34Q8IZ02 419 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 AADATQ8N5Z0 425 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 CD200R1Q8TD46 325 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 SCAMP4Q969E2 229 aa9.49□□□□□ -0.89
HDLBP-211ENST00000425989 HIC2Q96JB3 615 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms