RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 LHX1P48742 406 aa8.26□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 CDK18Q07002 472 aa8.26□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 TRIM32Q13049 653 aa8.26□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.26□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 PYCR3Q53H96 274 aa8.26□□□□□ -1.09
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SNX13-201ENST00000409076 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.25□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 SYVN1Q86TM6 617 aa8.25□□□□□ -1.09
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SNX13-201ENST00000409076 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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SNX13-201ENST00000409076 CYBBP04839 570 aa8.25□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 AKT1P31749 480 aa8.25□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 PRKAA2P54646 552 aa8.25□□□□□ -1.09
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SNX13-201ENST00000409076 AHSA2Q719I0 299 aa8.25□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 PAGE2Q7Z2X7 111 aa8.25□□□□□ -1.09
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SNX13-201ENST00000409076 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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SNX13-201ENST00000409076 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 KIFC1Q9BW19 673 aa8.25□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.25□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 DPY30Q9C005 99 aa8.25□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 TOR3AQ9H497 397 aa8.25□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 ACTR8Q9H981 624 aa8.25□□□□□ -1.09
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SNX13-201ENST00000409076 TRIM17Q9Y577 477 aa8.25□□□□□ -1.09
SNX13-201ENST00000409076 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.25□□□□□ -1.09
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