RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP10A1A4S6 786 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 OR52A4PA6NMU1 304 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 PDZK1P1A8MUH7 402 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 PRPSAP2O60256 369 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 PRLP01236 227 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 CDH6P55285 790 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ITGA1P56199 1179 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 GPS2Q13227 327 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 INSCQ1MX18 579 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 LCN10Q6JVE6 187 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 CRTC3Q6UUV7 619 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TMCO3Q6UWJ1 677 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 IQCKQ8N0W5 287 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ATPAF2Q8N5M1 289 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TEX26Q8N6G2 289 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 MOCOSQ96EN8 888 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM7Q9C029 511 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 RAB33BQ9H082 229 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 CHST8Q9H2A9 424 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 FGF21Q9NSA1 209 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 POT1Q9NUX5 634 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 GPR83Q9NYM4 423 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TAS2R14Q9NYV8 317 aa18.93■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 PCSK5Q92824 1860 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 C2CD3Q4AC94 2353 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 RNF8O76064 485 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 RPL10P27635 214 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 PDE1BQ01064 536 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 DSC2Q02487 901 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ACY1Q03154 408 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 RAPSNQ13702 412 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 DPCR1Q3MIW9 517 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 IZUMO3Q5VZ72 239 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 GLIS1Q8NBF1 620 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 SLC38A9Q8NBW4 561 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 UBXN4Q92575 508 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ZWILCHQ9H900 591 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 WASH6PQ9NQA3 447 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 DNPEPQ9ULA0 475 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 AKAP9Q99996 3911 aa18.92■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 H3BRJ5 948 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 IL4RP24394 825 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 CDK18Q07002 472 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 LPCAT1Q8NF37 534 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 LYSMD1Q96S90 227 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 MAP3K3Q99759 626 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM39Q9HCM9 518 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 PARVAQ9NVD7 372 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 PKD2L2Q9NZM6 624 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM10Q9UDY6 481 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 SNX7Q9UNH6 387 aa18.91■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM191CA6NGB0 347 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 CHUKO15111 745 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 SCRG1O75711 98 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 MTA2O94776 668 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 JCHAINP01591 159 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 DRG2P55039 364 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 POLNQ7Z5Q5 900 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB2Q8N680 514 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 CXorf40BQ96DE9 158 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 CSPG4P5Q96PW8 444 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 APCP25054 2843 aa18.9■□□□□ 0.62
HOXD12-201ENST00000404162 TMCO5BA8MYB1 307 aa18.89■□□□□ 0.61
HOXD12-201ENST00000404162 F5H423 210 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
HOXD12-201ENST00000404162 KMOO15229 486 aa18.89■□□□□ 0.61
HOXD12-201ENST00000404162 IL1R2P27930 398 aa18.89■□□□□ 0.61
HOXD12-201ENST00000404162 ARL4AP40617 200 aa18.89■□□□□ 0.61
HOXD12-201ENST00000404162 VAV2P52735 878 aa18.89■□□□□ 0.61
HOXD12-201ENST00000404162 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
HOXD12-201ENST00000404162 DPYSL2Q16555 572 aa18.89■□□□□ 0.61
HOXD12-201ENST00000404162 SMTNL2Q2TAL5 461 aa18.89■□□□□ 0.61
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa18.89■□□□□ 0.61
HOXD12-201ENST00000404162 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms