RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399808.4

IFITM3-201, Transcript of interferon induced transmembrane protein 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene IFITM3, Length 808 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3-201ENST00000399808 IRGCQ6NXR0 463 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 EID2BQ96D98 161 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 C5orf34Q96MH7 638 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 LYSMD1Q96S90 227 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 OR2AG1Q9H205 316 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 PDE7BQ9NP56 450 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 F8P00451 2351 aa14.76□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 OR52A4PA6NMU1 304 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ZNF185O15231 689 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 RNF8O76064 485 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TCF4P15884 667 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 DESP17661 470 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 DSC2Q02487 901 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 GPS2Q13227 327 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 KRT31Q15323 416 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SYCP1Q15431 976 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 DPYSL2Q16555 572 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ATPAF2Q8N5M1 289 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TTC13Q8NBP0 860 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SYT11Q9BT88 431 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ZWILCHQ9H900 591 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TRIM39Q9HCM9 518 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 FGF21Q9NSA1 209 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 PARVAQ9NVD7 372 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 APCP25054 2843 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 OTOGQ6ZRI0 2925 aa14.75□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 A6NL46 340 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 H3BRJ5 948 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TMEM63AO94886 807 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 EBLN1P0CF75 366 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 IL4RP24394 825 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 RPL10P27635 214 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ITGA1P56199 1179 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ITKQ08881 620 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 IZUMO3Q5VZ72 239 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 HPS6Q86YV9 775 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 GLIS1Q8NBF1 620 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 MR1Q95460 341 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 CSPG4P5Q96PW8 444 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 MAP3K3Q99759 626 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 CHST8Q9H2A9 424 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 POT1Q9NUX5 634 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 DNPEPQ9ULA0 475 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa14.74□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ANKRD12Q6UB98 2062 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 PDZD2O15018 2839 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TMCO5BA8MYB1 307 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 JCHAINP01591 159 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 GRNP28799 593 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 ARL4AP40617 200 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 QPCTQ16769 361 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 INSCQ1MX18 579 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 CRB2Q5IJ48 1285 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SLC34A3Q8N130 599 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 LPCAT1Q8NF37 534 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 UBXN4Q92575 508 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 PCDH9Q9HC56 1237 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 WASH6PQ9NQA3 447 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 PKD2L2Q9NZM6 624 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 WDR37Q9Y2I8 494 aa14.73□□□□□ -0.05
IFITM3-201ENST00000399808 SVILO95425 2214 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms