RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SPACA3Q8IXA5 215 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 OR4K2Q8NGD2 314 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 BRSK1Q8TDC3 778 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ATG4AQ8WYN0 398 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC45Q96CN5 670 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC25Q96NG3 672 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TIMM29Q9BSF4 260 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 PISDQ9UG56 409 aa19.95■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 A0A0G2JNG1 304 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 KIR2DS3K7RE56 304 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CSF2RBP32927 897 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 NFATC2Q13469 925 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 KIR2DS5Q14953 304 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS6KA1Q15418 735 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 LDLRAP1Q5SW96 308 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 GPRC6AQ5T6X5 926 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 MEI1Q5TIA1 1274 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 DENND5AQ6IQ26 1287 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CLEC14AQ86T13 490 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC9B2Q86UD5 537 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 DDHD1Q8NEL9 900 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNE4Q8WWG9 221 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CMKLR1Q99788 373 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ZMYND15Q9H091 742 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 FKBPLQ9UIM3 349 aa19.94■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM208BQ5VWN6 2430 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 OR5K4A6NMS3 321 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 PRAMEF1O95521 474 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CRTAMO95727 393 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 GPLD1P80108 840 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CCZ1BP86790 482 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CFHR1Q03591 330 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TLE3Q04726 772 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 C16orf72Q14CZ0 275 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 P3H1Q32P28 736 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 KCTD11Q693B1 232 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 JAMLQ86YT9 394 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 OR10G6Q8NH81 332 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF398Q8TD17 642 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM159Q96B96 161 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SH3KBP1Q96B97 665 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC74BQ96LY2 380 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ALS2CR12Q96Q35 445 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ARNT2Q9HBZ2 717 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SMOXQ9NWM0 555 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CPNE7Q9UBL6 633 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 DSPP15924 2871 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 PDZK1P1A8MUH7 402 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 LIASO43766 372 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ITIH1P19827 911 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 AKT1P31749 480 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TMPRSS15P98073 1019 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SQSTM1Q13501 440 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF662Q6ZS27 426 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 C11orf96Q7Z7L8 435 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 AVL9Q8NBF6 648 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 RCBTB1Q8NDN9 531 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 OR4D9Q8NGE8 314 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 OR13C4Q8NGS5 318 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC40Q9H9A6 602 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM9Q9P0T7 183 aa19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP19.92■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CHD6Q8TD26 2715 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 PRR19A6NJB7 356 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 KLK10O43240 276 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 DUX1O43812 170 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 NRDCO43847 1150 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SRP72O76094 671 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 VCLP18206 1134 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 MPSTP25325 297 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 RPL10P27635 214 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC5A2P31639 672 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ETV5P41161 510 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 MAPK9P45984 424 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 CTSCP53634 463 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 LIMK2P53671 638 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 PDE1BQ01064 536 aa19.91■□□□□ 0.78
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM220Q6QAJ8 160 aa19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms