RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 PTPN6P29350 595 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 IDUAP35475 653 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PBX1P40424 430 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LIG4P49917 911 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PTH1RQ03431 593 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 IL24Q13007 206 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SNX1Q13596 522 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SLC18A3Q16572 532 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC55Q6ZSA7 311 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PM20D2Q8IYS1 436 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 EXD1Q8NHP7 514 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 BBS10Q8TAM1 723 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DNASE1L2Q92874 299 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NACC2Q96BF6 587 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PAFAH2Q99487 392 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SELENOSQ9BQE4 189 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM168Q9H0V1 697 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 EHD1Q9H4M9 534 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SH2B3Q9UQQ2 575 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PATJQ8NI35 1801 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 UQCRHLA0A096LP55 91 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SPRY2O43597 315 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TADA2AO75478 443 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 IDH1O75874 414 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 WDR47O94967 919 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MED26O95402 600 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KRT14P02533 472 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 C8AP07357 584 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 UQCRHP07919 91 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FAM58BPP0C7Q3 252 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 C8orf89P0DMQ9 161 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC192P0DO97 292 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KRT3P12035 628 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC130P13994 396 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CPA1P15085 419 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CHMLP26374 656 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PSMA5P28066 241 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PDHA2P29803 388 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ATP5OP48047 213 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LOXL3P58215 753 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 BNIP3Q12983 259 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PDCLQ13371 301 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CAMK2DQ13557 499 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DPYSL2Q16555 572 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TIGD5Q53EQ6 642 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL7Q8IXQ5 586 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SYNE4Q8N205 404 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 STPG3Q8N7X2 389 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MB21D1Q8N884 522 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SHCBP1Q8NEM2 672 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 BPIFB1Q8TDL5 484 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 STAMQ92783 540 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SNAPC3Q92966 411 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ABHD8Q96I13 439 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TBC1D32Q96NH3 1257 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CD180Q99467 661 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PKP4Q99569 1192 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PIGQQ9BRB3 760 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 NUP85Q9BW27 656 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 THAP1Q9NVV9 213 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ING3Q9NXR8 418 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SPASTQ9UBP0 616 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FANCIQ9NVI1 1328 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SACSQ9NZJ4 4579 aa2.5□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC72A6NJI9 287 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 PER2O15055 1255 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TGFAP01135 160 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 AMHP03971 560 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 C8BP07358 591 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ATF2P15336 505 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GYPEP15421 78 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 TCF4P15884 667 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 SOAT1P35610 550 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ETV1P50549 477 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 HK2P52789 917 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 GAD2Q05329 585 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CUL2Q13617 745 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 FUT11Q495W5 492 aa2.49□□□□□ -2.01
CCSAP-202ENST00000366686 CDKAL1Q5VV42 579 aa2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms