RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363350.1

RNU6-179P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 179, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-179P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-179P-201ENST00000363350 TMEM255BQ8WV15 326 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 KLHL9Q9P2J3 617 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF711Q9Y462 761 aa3.07□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 A0A1W2PS18 150 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 OR5K3A6NET4 321 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 TMEM178BH3BS89 294 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 TMCC2O75069 709 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 WDR1O75083 606 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF217O75362 1048 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 GPC4O75487 556 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 GFPT2O94808 682 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 TUBBP07437 444 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 CSH1P0DML2 217 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 CSH2P0DML3 217 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 PORP16435 677 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 COG7P83436 770 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 EPS8Q12929 822 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 CCDC96Q2M329 555 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 RAD9BQ6WBX8 426 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 BRINP3Q76B58 766 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF534Q76KX8 674 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 BHLHA9Q7RTU4 235 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 PCGF5Q86SE9 256 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 DSG4Q86SJ6 1040 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SMIM29Q86T20 159 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 EXOC3L1Q86VI1 746 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 CEP97Q8IW35 865 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 MAP7D3Q8IWC1 876 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 EMC1Q8N766 993 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 MOAP1Q96BY2 351 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 FEM1CQ96JP0 617 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 LMLNQ96KR4 655 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC22A12Q96S37 553 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SMC6Q96SB8 1091 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 NEURL2Q9BR09 285 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 DONSONQ9NYP3 566 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 TSPYL4Q9UJ04 414 aa3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 TAF1P21675 1872 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 PRAG1Q86YV5 1406 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 A0A1W2PQ09 198 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 C5orf60A6NFR6 353 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 BMPR1BO00238 502 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 TSPAN9O75954 239 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 PRLRP16471 622 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 AMD1P17707 334 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 GM2AP17900 193 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 ACSL1P33121 698 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC15A1P46059 708 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SUOXP51687 545 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 CTSCP53634 463 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 PNLIPRP2P54317 469 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 MFAP4P55083 255 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 PLIN5Q00G26 463 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 CXCL9Q07325 125 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 CHAF1BQ13112 559 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 WTAPQ15007 396 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 CFAP161Q6P656 301 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC9B2Q86UD5 537 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 GALNT13Q8IUC8 556 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SLC5A8Q8N695 610 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 CD101Q93033 1021 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 PHF21AQ96BD5 680 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 SEMA3CQ99985 751 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 LRRC1Q9BTT6 524 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 HRH4Q9H3N8 390 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 FKRPQ9H9S5 495 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 DNAJB4Q9UDY4 337 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 POU2F3Q9UKI9 436 aa3.05□□□□□ -1.92
RNU6-179P-201ENST00000363350 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms