RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 INHBAP08476 426 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFC1BP0CG36 223 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFC1P0CG37 223 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 FGF5P12034 268 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM11P17152 192 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GM2AP17900 193 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIST1H2ADP20671 130 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT32Q14532 448 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCGF3Q3KNV8 242 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAAH2Q6GMR7 532 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAM5Q6NVV9 412 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM154Q6P9G4 183 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SARM1Q6SZW1 724 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q75L30 129 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPAN33Q86UF1 283 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 LONP2Q86WA8 852 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GBGT1Q8N5D6 347 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC5A8Q8N695 610 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC38A9Q8NBW4 561 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHDC9Q8NEP7 349 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR10V1Q8NGI7 309 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRPC4APQ8TEL6 797 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 POMGNT1Q8WZA1 660 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPP4Q96JB8 637 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUX3Q96PT4 197 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUDCD1Q96RS6 583 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 NCAPGQ9BPX3 1015 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRPC7Q9HCX4 862 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMC4Q9NTJ3 1288 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A087X0M5 115 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0G2JNG1 304 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1B0GX30 115 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PMS2P5A8MQ11 134 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 OGG1O15527 345 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLPP2O43688 288 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 EDIL3O43854 480 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZG16O60844 167 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPC4O75487 556 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 BAG4O95429 457 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT19P08727 400 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACTN1P12814 892 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAMP2P13473 410 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR1D1P20393 614 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACADLP28330 430 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCTP40126 519 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MSH2P43246 934 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR143P51810 404 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTSCP53634 463 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SETQ01105 290 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MVPQ14764 893 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIR2DS5Q14953 304 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASPRV1Q53RT3 343 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB6CQ53S08 254 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SFMBT2Q5VUG0 894 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNX30Q5VWJ9 437 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 HAUS3Q68CZ6 603 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC35E4Q6ICL7 350 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC27A1Q6PCB7 646 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL35Q6PF15 583 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEACAM20Q6UY09 585 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 IKBIPQ70UQ0 350 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GCSAMQ8N6F7 178 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RDM1Q8NG50 284 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSDMBQ8TAX9 411 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TM9SF4Q92544 642 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOAP1Q96BY2 351 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB6CQ9H0N0 254 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KAT14Q9H8E8 782 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCRT2Q9NQ03 307 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SETD4Q9NVD3 440 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 JRKLQ9Y4A0 524 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SESN1Q9Y6P5 492 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 C5orf60A6NFR6 353 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PGPEP1LA6NFU8 196 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 C15orf62A8K5M9 175 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 A8MZ25 164 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO1GB0I1T2 1018 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB43O43298 467 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 HS6ST1O60243 411 aa2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms