RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 OR2T11Q8NH01 316 aa22.33■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ZFAND2BQ8WV99 257 aa22.33■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 VOPP1Q96AW1 172 aa22.33■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 GCNAQ96QF7 691 aa22.33■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.33■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 LRRC3Q9BY71 257 aa22.33■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 PIDD1Q9HB75 910 aa22.33■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 MAP10Q9P2G4 905 aa22.33■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ASB3Q9Y575 518 aa22.33■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CLTBP09497 229 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 LAG3P18627 525 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CCR2P41597 374 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 TGFBIQ15582 683 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 NUDT8Q8WV74 236 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 KCNJ9Q92806 393 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CIPCQ9C0C6 399 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 IL26Q9NPH9 171 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 TRIM24O15164 1050 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 FGF18O76093 207 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 OR4F21O95013 312 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 PTGER3P43115 390 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 SLC7A2P52569 658 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CACNG1Q06432 222 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 BCL2L1Q07817 233 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 IL23RQ5VWK5 629 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 RFLNAQ6ZTI6 216 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CORO1BQ9BR76 489 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 C1orf50Q9BV19 199 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 SLC25A23Q9BV35 468 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ASB8Q9H765 288 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.32■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 STX1BP61266 288 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 FBXL19Q6PCT2 694 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CDYL2Q8N8U2 506 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 FAM210AQ96ND0 272 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 RIMS3Q9UJD0 308 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 E2F3O00716 465 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CCL16O15467 120 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 KLK8O60259 260 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CLCN4P51793 760 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 TBC1D25Q3MII6 688 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 FAM217AQ8IXS0 508 aa22.31■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 SYCE1LA8MT33 242 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 SNX2O60749 519 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 TRIM16O95361 564 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 GUCA1CO95843 209 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 TRBC1P01850 177 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 BPIP17213 487 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 MAPRE2Q15555 327 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CDKN3Q16667 212 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ITIH5Q86UX2 942 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 VPS33AQ96AX1 596 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ABCB8Q9NUT2 735 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 HACD3Q9P035 362 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CROTQ9UKG9 612 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 SARDHQ9UL12 918 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 PCDHGB4Q9UN71 923 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 LATS1O95835 1130 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ESR1P03372 595 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 LYNP07948 512 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 PLEKHG6Q3KR16 790 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 RNF220Q5VTB9 566 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 RETSATQ6NUM9 610 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 FIBCD1Q8N539 461 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ASB2Q96Q27 587 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 SPAG4Q9NPE6 437 aa22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 LEFTY2O00292 366 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 TXNDC9O14530 226 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 C8AP07357 584 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 SOX11P35716 441 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ERVPABLB-1P60509 514 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 AP1S1P61966 158 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 CHRNA6Q15825 494 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 OR52E8Q6IFG1 317 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 LETMD1Q6P1Q0 360 aa22.29■■□□□ 1.16
C9orf163-201ENST00000354376 TCEAL4Q96EI5 215 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms