RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX101Q9BY14 249 aa27.11■■□□□ 1.93
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CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL12A8MUP2 240 aa27.07■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C10orf142B7Z368 130 aa27.07■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF460Q14592 562 aa27.06■■□□□ 1.92
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM220Q6QAJ8 160 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIM3Q86V86 326 aa27.06■■□□□ 1.92
CTDNEP1-201ENST00000318988 LGR4Q9BXB1 951 aa27.06■■□□□ 1.92
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