RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 ESRRBO95718 433 aa25.09■■□□□ 1.61
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HOXB3-201ENST00000311626 CCT8P50990 548 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-201ENST00000311626 ERVPABLB-1P60509 514 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-201ENST00000311626 CTBSQ01459 385 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-201ENST00000311626 SELPLGQ14242 412 aa25.09■■□□□ 1.61
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HOXB3-201ENST00000311626 PSKH2Q96QS6 385 aa25.09■■□□□ 1.61
HOXB3-201ENST00000311626 NANOGQ9H9S0 305 aa25.09■■□□□ 1.61
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HOXB3-201ENST00000311626 ATP6AP1Q15904 470 aa25.08■■□□□ 1.61
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HOXB3-201ENST00000311626 BBS5Q8N3I7 341 aa25.08■■□□□ 1.61
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HOXB3-201ENST00000311626 PRR35P0CG20 571 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 UROSP10746 265 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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HOXB3-201ENST00000311626 FAM26DQ5JW98 314 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 C6orf136Q5SQH8 315 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 BORAQ6PGQ7 559 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 TRAF7Q6Q0C0 670 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 Q6ZSR9 355 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 PEX13Q92968 403 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 PREBQ9HCU5 417 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 SYCE1LA8MT33 242 aa25.07■■□□□ 1.6
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HOXB3-201ENST00000311626 SNAP29O95721 258 aa25.07■■□□□ 1.6
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HOXB3-201ENST00000311626 LPOP22079 712 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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HOXB3-201ENST00000311626 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 BIRC7Q96CA5 298 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 MAGEH1Q9H213 219 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 SYN3O14994 580 aa25.06■■□□□ 1.6
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HOXB3-201ENST00000311626 PCNAP12004 261 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 HRH2P25021 359 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 SLC11A1P49279 550 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 IL2P60568 153 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 RING1Q06587 406 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 TRAF2Q12933 501 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 XKR7Q5GH72 579 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 SPATA19Q7Z5L4 167 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 ABI1Q8IZP0 508 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 SFRP1Q8N474 314 aa25.06■■□□□ 1.6
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HOXB3-201ENST00000311626 PROKR1Q8TCW9 393 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 RNF145Q96MT1 663 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 MARCH5Q9NX47 278 aa25.06■■□□□ 1.6
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HOXB3-201ENST00000311626 GOLGA8CPA6NN73 597 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 GIPC1O14908 333 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 CHEK2O96017 543 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 PYGLP06737 847 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 RHOCP08134 193 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 CA5AP35218 305 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 RANBP1P43487 201 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 HPCAP84074 193 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 CDC14AQ9UNH5 594 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 COMMD10Q9Y6G5 202 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXB3-201ENST00000311626 KLHL33A6NCF5 533 aa25.05■■□□□ 1.6
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