RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 PYCR3Q53H96 274 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 MRNIPQ6NTE8 343 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 NEPROQ6NW34 567 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 PACS1Q6VY07 963 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 TAS2R42Q7RTR8 314 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 OR2I1PQ8NGU4 316 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 GSDMBQ8TAX9 411 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CALML6Q8TD86 181 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CERS2Q96G23 380 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CFAP36Q96G28 342 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 TTC25Q96NG3 672 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 OR2M4Q96R27 311 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 TTC1Q99614 292 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC61Q9BV99 259 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 SLC13A1Q9BZW2 595 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 TM7SF3Q9NS93 570 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 SPASTQ9UBP0 616 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 NFU1Q9UMS0 254 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 DNAH14Q0VDD8 3507 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 GOLGA8KD6RF30 607 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 GOLGA8TH3BQL2 631 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 GSTA2P09210 222 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 PLA2G5P39877 138 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 MAGEA4P43358 317 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 GNPDA1P46926 289 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 LIMK1P53667 647 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 SLC14A1Q13336 389 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 BCL7AQ4VC05 210 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 DBX2Q6ZNG2 339 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 RD3Q7Z3Z2 195 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 KCNMB4Q86W47 210 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC25Q86WR0 208 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 GALNT13Q8IUC8 556 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CILP2Q8IUL8 1156 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF547Q8IVP9 402 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CNTN4Q8IWV2 1026 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 UNC5BQ8IZJ1 945 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 SAP25Q8TEE9 199 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 DCUN1D1Q96GG9 259 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 C9orf72Q96LT7 481 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 TCF12Q99081 682 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 FAM167BQ9BTA0 163 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 BOCQ9BWV1 1114 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CAAP1Q9H8G2 361 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 MOCS1Q9NZB8 636 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 MOSPD1Q9UJG1 213 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 GPR34Q9UPC5 381 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa13.07□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CEP250Q9BV73 2442 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 GRID2O43424 1007 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 SGTAO43765 313 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 SPAG6O75602 509 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 AP2A2O94973 939 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 DGKAP23743 735 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 SSTR1P30872 391 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 PRLHRP49683 370 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CTSCP53634 463 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 BNIP3Q12983 259 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 LRP8Q14114 963 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 PRRT3Q5FWE3 981 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF470Q6ECI4 717 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF449Q6P9G9 518 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 CYS1Q717R9 158 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 C11orf96Q7Z7L8 435 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 LRRTM4Q86VH4 590 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 PALM2Q8IXS6 379 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 GPBAR1Q8TDU6 330 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 UBXN4Q92575 508 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 FAM122AQ96E09 287 aa13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM168Q9H0V1 697 aa13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms