RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293349.10

PLEKHH3-201, Transcript of pleckstrin homology, MyTH4 and FERM domain containing H3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PLEKHH3, Length 2,987 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHH3-201ENST00000293349 LAPTM5Q13571 262 aa20.08■□□□□ 0.81
PLEKHH3-201ENST00000293349 SELPLGQ14242 412 aa20.08■□□□□ 0.81
PLEKHH3-201ENST00000293349 ANKS6Q68DC2 871 aa20.08■□□□□ 0.81
PLEKHH3-201ENST00000293349 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PLEKHH3-201ENST00000293349 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa20.08■□□□□ 0.81
PLEKHH3-201ENST00000293349 HS3ST5Q8IZT8 346 aa20.08■□□□□ 0.81
PLEKHH3-201ENST00000293349 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.08■□□□□ 0.81
PLEKHH3-201ENST00000293349 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.08■□□□□ 0.81
PLEKHH3-201ENST00000293349 A8MX80 341 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 BMP2P12643 396 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 IL12AP29459 219 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 STC1P52823 247 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 PIGFQ07326 219 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 LCP2Q13094 533 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 FGD3Q5JSP0 725 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 ANKFN1Q8N957 763 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 ROPN1LQ96C74 230 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 NACA2Q9H009 215 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 CAPNS1P04632 268 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZNF12P17014 697 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 KANK2Q63ZY3 851 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 TAS2R42Q7RTR8 314 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 EXD2Q9NVH0 621 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 GID8Q9NWU2 228 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 FKBPLQ9UIM3 349 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 A0A0U1RQF3 1178 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 CBX4O00257 560 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SERPINF2P08697 491 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 TBCDQ9BTW9 1192 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 MED16Q9Y2X0 877 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SQORQ9Y6N5 450 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 M0QZQ0 153 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 FFAR3O14843 346 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 GPR42O15529 346 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SNX2O60749 519 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 ATP6V0D1P61421 351 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SEMG2Q02383 582 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 PARP8Q8N3A8 854 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SCAIQ8N9R8 606 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 TOP1MTQ969P6 601 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SLC39A13Q96H72 371 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SUSD3Q96L08 255 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 ADNPQ9H2P0 1102 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 TMEM248Q9NWD8 314 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 TAS2R13Q9NYV9 303 aa20.07■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 IRF1P10914 325 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 DNAJB1P25685 340 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SERINC3Q13530 473 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SLC14A2Q15849 920 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 OR6K2Q8NGY2 324 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 STAG3L4Q8TBR4 150 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 TBC1D15Q8TC07 691 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 LINGO1Q96FE5 620 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 C5orf42Q9H799 3197 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 MAN1A2O60476 641 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 GATMP50440 423 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 CCT8P50990 548 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 BCL2A1Q16548 175 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 DHRSXQ8N5I4 330 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 FBXO30Q8TB52 745 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 NANOGQ9H9S0 305 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 ARMC1Q9NVT9 282 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 ACTR3BQ9P1U1 418 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 UTS2RQ9UKP6 389 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 GPR45Q9Y5Y3 372 aa20.06■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.05■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.05■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.05■□□□□ 0.8
PLEKHH3-201ENST00000293349 SLC22A3O75751 556 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms