RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RGS10O43665 173 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CCNB2O95067 398 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 GSTT2BP0CG30 244 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 NR4A1P22736 598 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 AKT2P31751 481 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PTGER3P43115 390 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CBX5P45973 191 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 STARP49675 285 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ERVK-21P61565 698 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CRADDP78560 199 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 KLHL26Q53HC5 615 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ZNF311Q5JNZ3 666 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 KCTD13Q8WZ19 329 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SPOCK2Q92563 424 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PIK3R3Q92569 461 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 AGAP2Q99490 1192 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TAPBPLQ9BX59 468 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TM6SF2Q9BZW4 377 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MAP10Q9P2G4 905 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TMEM88BA6NKF7 163 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TEX46H3BTG2 121 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 REM1O75628 298 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 STK16O75716 305 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DHFRP00374 187 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 IFNW1P05000 195 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 S100A6P06703 90 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CBSLP0DN79 551 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CD247P20963 164 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CBSP35520 551 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PIK3CBP42338 1070 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 LIPEQ05469 1076 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TSTD2Q5T7W7 516 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CRTC3Q6UUV7 619 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RNF148Q8N7C7 305 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 OR10G6Q8NH81 332 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 AGAP11Q8TF27 550 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MNTQ99583 582 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SEC14L3Q9UDX4 400 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CHP2O43745 196 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 B3GALT2O43825 422 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PGK1P00558 417 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 NTRK1P04629 796 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SLC35G6P0C7Q6 338 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CCR10P46092 362 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CAP1Q01518 475 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 MYBPC3Q14896 1274 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DCST1Q5T197 706 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 STX12Q86Y82 276 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SLC38A4Q969I6 547 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 FEM1CQ96JP0 617 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PRRG4Q9BZD6 226 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 COMMD4Q9H0A8 199 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 C14orf105Q9NVL8 296 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CHKBQ9Y259 395 aa7.16□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 A0A0X1KG70 313 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TNFRSF11BO00300 401 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CLDN5O00501 218 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 PRODHO43272 600 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 B4GALT5O43286 388 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RFC2P35250 354 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 USP4Q13107 963 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 KLF10Q13118 480 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CTBP1Q13363 440 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 CAMK1Q14012 370 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DGCR6Q14129 220 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 ZNF554Q86TJ5 538 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 AKAP14Q86UN6 197 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 C7orf57Q8NEG2 295 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 COPS7AQ9UBW8 275 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 Q9Y3F1 56 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 FAM92AA1XBS5 289 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 SLC7A4O43246 635 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 KRT36O76013 467 aa7.15□□□□□ -1.26
CPS1-201ENST00000233072 TM7SF2O76062 418 aa7.15□□□□□ -1.26
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