RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619193.4

RDM1-223, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-223	ENST00000619193	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	USP21	Q9UK80	565 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	TECPR2	O15040	1411 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	CHADL	Q6NUI6	762 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	KIF2C	Q99661	725 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	GLI3	P10071	1580 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	NUCB1	Q02818	461 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	PRAM1	Q96QH2	718 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	POLK	Q9UBT6	870 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		7.54	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	ABCC4	O15439	1325 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	PEAK1	Q9H792	1746 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	IL13	P35225	146 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	CDK19	Q9BWU1	502 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		7.53	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		7.52	□□□□□ -1.2
RDM1-223	ENST00000619193	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	VAMP4	O75379	141 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	FCHSD2	O94868	740 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	BECN1	Q14457	450 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	SNX21	Q969T3	373 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	CREBZF	Q9NS37	354 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	ATP10D	Q9P241	1426 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	KIF16B	Q96L93	1317 aa		7.52	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	FBLN1	P23142	703 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	MCM4	P33991	863 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	RIPK4	P57078	832 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	NFE2L2	Q16236	605 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	ZNF428	Q96B54	188 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	STK26	Q9P289	416 aa		7.51	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	PRKAR2B	P31323	418 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	TSPYL6	Q8N831	410 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	CABP1	Q9NZU7	370 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	EID1	Q9Y6B2	187 aa		7.5	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	ITSN1	Q15811	1721 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	LRRC37A3	O60309	1634 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	MET	P08581	1390 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	C14orf37	Q86TY3	774 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	IFT57	Q9NWB7	429 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	SSH2	Q76I76	1423 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		7.49	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	SIRT1	Q96EB6	747 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	CRB1	P82279	1406 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	MST1R	Q04912	1400 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		7.47	□□□□□ -1.21
RDM1-223	ENST00000619193	NME9	Q86XW9	330 aa		7.47	□□□□□ -1.21

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