RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 TECPR2O15040 1411 aa13.21□□□□□ -0.29
FCHO1-216ENST00000596536 CPS1P31327 1500 aa13.21□□□□□ -0.29
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF853P0CG23 659 aa13.21□□□□□ -0.29
FCHO1-216ENST00000596536 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa13.21□□□□□ -0.29
FCHO1-216ENST00000596536 GAS2L2Q8NHY3 880 aa13.21□□□□□ -0.29
FCHO1-216ENST00000596536 GRPEL1Q9HAV7 217 aa13.21□□□□□ -0.29
FCHO1-216ENST00000596536 MED14O60244 1454 aa13.21□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 SSFA2P28290 1259 aa13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 NECTIN2Q92692 538 aa13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 ABCC4O15439 1325 aa13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 FOXO3O43524 673 aa13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 ARID3AQ99856 593 aa13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 FAM13BQ9NYF5 915 aa13.2□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 F6X3S4 739 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 TSHZ3Q63HK5 1081 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 ARHGAP45Q92619 1136 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 MEIS3Q99687 375 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 PRR36Q9H6K5 1346 aa13.19□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 CDC45O75419 566 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF428Q96B54 188 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 DDX11L8A8MPP1 907 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 LTKP29376 864 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 SIRT1Q96EB6 747 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 SLIT1O75093 1534 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 LMOD3Q0VAK6 560 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 GAS2L3Q86XJ1 694 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 SNX21Q969T3 373 aa13.18□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 MAP7D2Q96T17 732 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 SLC4A2P04920 1241 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 NCLP19338 710 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 PRDM10Q9NQV6 1147 aa13.17□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 DDIT3P35638 169 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 CHAMP1Q96JM3 812 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 KIF20BQ96Q89 1820 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 ATP7BP35670 1465 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 PTCH1Q13635 1447 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 GBP4Q96PP9 640 aa13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 PKP1Q13835 747 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 RAB3GAP1Q15042 981 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 G2E3Q7L622 706 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 DCTPP1Q9H773 170 aa13.15□□□□□ -0.3
FCHO1-216ENST00000596536 ACEP12821 1306 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 SDSP20132 328 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 TTC22Q5TAA0 569 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 MSH6P52701 1360 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 OFD1O75665 1012 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 CEP85Q6P2H3 762 aa13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa13.13□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 PIK3R4Q99570 1358 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 MCTP1Q6DN14 999 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 ANKRD44Q8N8A2 993 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 TSPYL4Q9UJ04 414 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 DIP2AQ14689 1571 aa13.12□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 CHL1O00533 1208 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 ROBO2Q9HCK4 1378 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 EID1Q9Y6B2 187 aa13.11□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 MON2Q7Z3U7 1717 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 USP26Q9BXU7 913 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 TPRNQ4KMQ1 711 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 AKAP12Q02952 1782 aa13.1□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 BAG4O95429 457 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 TERF1P54274 439 aa13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
FCHO1-216ENST00000596536 MAP3K19Q56UN5 1328 aa13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms