RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 CARD14Q9BXL6 1004 aa9.52□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 NHSQ6T4R5 1651 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.51□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 NBPF14Q5TI25 921 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 RTL1A6NKG5 1358 aa9.5□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 BTAF1O14981 1849 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 NSD3Q9BZ95 1437 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.49□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNQ2O43526 872 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 PROM2Q8N271 834 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.48□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 ABCB7O75027 752 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 POLR3GLQ9BT43 218 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 INSRP06213 1382 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.47□□□□□ -0.89
EFTUD2-210ENST00000588340 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 NBPF4Q96M43 638 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 CGNL1Q0VF96 1302 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 FLT4P35916 1363 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 MEGF6O75095 1541 aa9.46□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 EVX2Q03828 476 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 TXNRD1Q16881 649 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 USHBP1Q8N6Y0 703 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 NSD2O96028 1365 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 CASZ1Q86V15 1759 aa9.45□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 PANK3Q9H999 370 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 ITGB4P16144 1822 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 LY75O60449 1722 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 PAPPAQ13219 1627 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC15A2Q16348 729 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 STK32BQ9NY57 414 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 POLKQ9UBT6 870 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 PKD1L3Q7Z443 1732 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 NCAPD2Q15021 1401 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 SPON1Q9HCB6 807 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 QSER1Q2KHR3 1735 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-210ENST00000588340 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa9.4□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 EYA1Q99502 592 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 TAF1LQ8IZX4 1826 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 CYP27B1O15528 508 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 ZBTB7AO95365 584 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 KNSTRNQ9Y448 316 aa9.38□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 ZNF827Q17R98 1081 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 MORC1Q86VD1 984 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 AKT1S1Q96B36 256 aa9.37□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 C5P01031 1676 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 PTGER2P43116 358 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNQ4P56696 695 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 MTFR1LQ9H019 292 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.911e-6■■□□□ 12.9
EFTUD2-210ENST00000588340 SPG7Q9UQ90 795 aa9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 COL24A1Q17RW2 1714 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa9.35□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 SGIP1Q9BQI5 828 aa9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
EFTUD2-210ENST00000588340 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 PHKG2P15735 406 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 PIGBQ92521 554 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 PALLDQ8WX93 1383 aa9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC16A10Q8TF71 515 aa9.32□□□□□ -0.92
EFTUD2-210ENST00000588340 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.2 ms