RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 DIP2AQ14689 1571 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 PTCH1Q13635 1447 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 TXNDC2Q86VQ3 553 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 COG3Q96JB2 828 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-208ENST00000587914 MAP3K13O43283 966 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 LMOD3Q0VAK6 560 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 PIK3R4Q99570 1358 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 MON2Q7Z3U7 1717 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIM66O15016 1216 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 IL13P35225 146 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 RIPK4P57078 832 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 PDE4DQ08499 809 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 NFE2L2Q16236 605 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM161AQ3B820 660 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 TTC21AQ8NDW8 1320 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 KIF16BQ96L93 1317 aa9.19□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 C3P01024 1663 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 POTEIP0CG38 1075 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 LTKP29376 864 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 PRKAR2BP31323 418 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 AKAP12Q02952 1782 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 USP31Q70CQ4 1352 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 NME9Q86XW9 330 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 PANK1Q8TE04 598 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 PRR36Q9H6K5 1346 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 IFT57Q9NWB7 429 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 COG6Q9Y2V7 657 aa9.18□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 USP6P35125 1406 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 SSH2Q76I76 1423 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 GNAI1P63096 354 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.17□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 NRKQ7Z2Y5 1582 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 PTPRUQ92729 1446 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 SMC4Q9NTJ3 1288 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 ITSN1Q15811 1721 aa9.16□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 KIF24Q5T7B8 1368 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 IGHDP01880 384 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF853P0CG23 659 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa9.15□□□□□ -0.94
EFTUD2-208ENST00000587914 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 ACEP12821 1306 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 RLBP1P12271 317 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 C8orf34Q49A92 452 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.14□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIM27P14373 513 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 ARID3AQ99856 593 aa9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 ARHGEF10O15013 1369 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 PHACTR3Q96KR7 559 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC26A8Q96RN1 970 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 BCL2L13Q9BXK5 485 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM117AQ9C073 453 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 SBNO1A3KN83 1393 aa9.11□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 VAMP4O75379 141 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 HMOX1P09601 288 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 RGS3P49796 1198 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 USP35Q9P2H5 1018 aa9.1□□□□□ -0.95
EFTUD2-208ENST00000587914 TRPC6Q9Y210 931 aa9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms