RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 NSD3Q9BZ95 1437 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 CDKL5O76039 1030 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM132AQ24JP5 1023 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 SPG7Q9UQ90 795 aa25.14■■□□□ 1.62
PTPRM-211ENST00000580170 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 BTBD11A6QL63 1104 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 ERLIN2O94905 339 aa25.14■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 NFE2L2Q16236 605 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 ATP2B2Q01814 1243 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 SYCE3A1L190 88 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 PDCL2Q8N4E4 241 aa25.13■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6L10A6NI86 522 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 KRT32Q14532 448 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 ERLIN1O75477 346 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.1■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 SOGA3Q5TF21 947 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 NCAPD3P42695 1498 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 TXLNBQ8N3L3 684 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 MAP3K11Q16584 847 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 SMTNL1A8MU46 457 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 CAMK4Q16566 473 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRM-211ENST00000580170 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa25.08■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 DDX11Q96FC9 970 aa25.08■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 TDO2P48775 406 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 UBAC1Q9BSL1 405 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.06■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 MX1P20591 662 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.05■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 SKAP1Q86WV1 359 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 FAM193AP78312 1265 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 CBX1P83916 185 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.04■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 PRXQ9BXM0 1461 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 NEFHP12036 1026 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 WASF1Q92558 559 aa25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 IQCEQ6IPM2 695 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 CENPHQ9H3R5 247 aa25.02■■□□□ 1.6
PTPRM-211ENST00000580170 FERMT3Q86UX7 667 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 MCM10Q7L590 875 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 RAB11FIP3O75154 756 aa25.01■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 RAI14Q9P0K7 980 aa25■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP100Q494V2 611 aa25■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 SSH1Q8WYL5 1049 aa25■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 ALDH1L2Q3SY69 923 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 GIMAP7Q8NHV1 300 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 TOP2BQ02880 1626 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.98■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 KIAA1328Q86T90 577 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 CEP131Q9UPN4 1083 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 NAIPQ13075 1403 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC102AQ96A19 550 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
PTPRM-211ENST00000580170 AIDAQ96BJ3 306 aa24.97■■□□□ 1.59
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