RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM57Q8N5G2 664 aa30.53■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NFAT5O94916 1531 aa30.52■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SEC24BO95487 1268 aa30.52■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GSE1Q14687 1217 aa30.52■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C19orf44Q9H6X5 657 aa30.52■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HSPA2P54652 639 aa30.51■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.51■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX19BQ9UMR2 479 aa30.51■■■□□ 2.48
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP30.5■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1orf167Q5SNV9 1468 aa30.5■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LMOD2Q6P5Q4 547 aa30.5■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL27Q8NEV9 243 aa30.49■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHL1O00533 1208 aa30.49■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KCNH5Q8NCM2 988 aa30.49■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAS2L2Q8NHY3 880 aa30.49■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IP6K1Q92551 441 aa30.47■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 USHBP1Q8N6Y0 703 aa30.47■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMEM94Q12767 1356 aa30.47■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRB1P82279 1406 aa30.47■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT24Q2M2I5 525 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STRCP1A6NGW2 1772 aa30.46■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT28Q7Z3Y7 464 aa30.45■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATF3P18847 181 aa30.43■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIF1AQ12756 1690 aa30.43■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MIS18AQ9NYP9 233 aa30.43■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GCP02774 474 aa30.42■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGAP45Q92619 1136 aa30.42■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa30.41■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.39■■■□□ 2.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MST1RQ04912 1400 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TSPYL4Q9UJ04 414 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLIT3O75094 1523 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIAA0232Q92628 1395 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GNAT3A8MTJ3 354 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NBPF6Q5VWK0 638 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NBPF4Q96M43 638 aa30.38■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ARHGEF25Q86VW2 580 aa30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAP3K5Q99683 1374 aa30.35■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MSH6P52701 1360 aa30.34■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABCC4O15439 1325 aa30.34■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP30.34■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCCP43146 1447 aa30.33■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP30.32■■■□□ 2.45
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RGPD2P0DJD1 1756 aa30.32■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LRRC37A3O60309 1634 aa30.32■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BECN1Q14457 450 aa30.31■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TBC1D32Q96NH3 1257 aa30.3■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa30.3■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL17REQ8NFR9 667 aa30.29■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa30.28■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CADPS2Q86UW7 1296 aa30.28■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALS2Q96Q42 1657 aa30.27■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BRPF3Q9ULD4 1205 aa30.27■■■□□ 2.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANKRD24Q8TF21 1146 aa30.26■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C1orf115Q9H7X2 142 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.25■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AXIN2Q9Y2T1 843 aa30.24■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ANTXR1Q9H6X2 564 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLC4A2P04920 1241 aa30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RGS12O14924 1447 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NPHP3Q7Z494 1330 aa30.21■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STRCQ7RTU9 1775 aa30.2■■■□□ 2.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SMC5Q8IY18 1101 aa30.19■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTPRCP08575 1304 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TBC1D2Q9BYX2 928 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RGPD5Q99666 1765 aa30.18■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LGR6Q9HBX8 967 aa30.16■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CABLES1Q8TDN4 633 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NCAPD2Q15021 1401 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 G2E3Q7L622 706 aa30.15■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNS3Q68CZ2 1445 aa30.14■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BABAM1Q9NWV8 329 aa30.14■■■□□ 2.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NECTIN2Q92692 538 aa30.14■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STK31Q9BXU1 1019 aa30.14■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERBB3P21860 1342 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AKAP4Q5JQC9 854 aa30.13■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AMOTQ4VCS5 1084 aa30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms