RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
EHD4-202ENST00000569223 SIRT2Q8IXJ6 389 aa29.16■■■□□ 2.26
EHD4-202ENST00000569223 EYA1Q99502 592 aa29.16■■■□□ 2.26
EHD4-202ENST00000569223 RGS12O14924 1447 aa29.15■■■□□ 2.26
EHD4-202ENST00000569223 FOXO3O43524 673 aa29.15■■■□□ 2.26
EHD4-202ENST00000569223 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 ANKRD45Q5TZF3 282 aa29.11■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 NUTM2GQ5VZR2 741 aa29.1■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.1■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 C22orf23Q9BZE7 217 aa29.1■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 LRRC37A3O60309 1634 aa29.09■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 HOXC9P31274 260 aa29.09■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 NWD1Q149M9 1564 aa29.09■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 MIS18AQ9NYP9 233 aa29.08■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 PTPRCP08575 1304 aa29.08■■■□□ 2.25
EHD4-202ENST00000569223 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.07■■■□□ 2.24
EHD4-202ENST00000569223 ABTB2Q8N961 1025 aa29.06■■■□□ 2.24
EHD4-202ENST00000569223 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.06■■■□□ 2.24
EHD4-202ENST00000569223 BMP2KLQ5H9B9 411 aa29.06■■■□□ 2.24
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.06■■■□□ 2.24
EHD4-202ENST00000569223 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
EHD4-202ENST00000569223 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.03■■■□□ 2.24
EHD4-202ENST00000569223 LTN1O94822 1766 aa29.03■■■□□ 2.24
EHD4-202ENST00000569223 ATP10DQ9P241 1426 aa29.02■■■□□ 2.24
EHD4-202ENST00000569223 MSH6P52701 1360 aa29.02■■■□□ 2.24
EHD4-202ENST00000569223 SLC4A2P04920 1241 aa29.01■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 RTL1A6NKG5 1358 aa29■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.99■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 DCTPP1Q9H773 170 aa28.99■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.99■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.98■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 GNAT3A8MTJ3 354 aa28.98■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 C14orf37Q86TY3 774 aa28.98■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa28.97■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 NFAT5O94916 1531 aa28.95■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 MAP3K5Q99683 1374 aa28.95■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 CEP85Q6P2H3 762 aa28.95■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
EHD4-202ENST00000569223 G2E3Q7L622 706 aa28.94■■■□□ 2.22
EHD4-202ENST00000569223 RBM25P49756 843 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
EHD4-202ENST00000569223 MEIS3Q99687 375 aa28.94■■■□□ 2.22
EHD4-202ENST00000569223 BCL11AQ9H165 835 aa28.93■■■□□ 2.22
EHD4-202ENST00000569223 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
EHD4-202ENST00000569223 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.9■■■□□ 2.22
EHD4-202ENST00000569223 IL17REQ8NFR9 667 aa28.9■■■□□ 2.22
EHD4-202ENST00000569223 IP6K1Q92551 441 aa28.9■■■□□ 2.22
EHD4-202ENST00000569223 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.89■■■□□ 2.22
EHD4-202ENST00000569223 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.89■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 GSE1Q14687 1217 aa28.88■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.88■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 STK31Q9BXU1 1019 aa28.88■■■□□ 2.21
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EHD4-202ENST00000569223 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
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EHD4-202ENST00000569223 BABAM1Q9NWV8 329 aa28.87■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
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EHD4-202ENST00000569223 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.86■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.86■■■□□ 2.21
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EHD4-202ENST00000569223 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 CDC45O75419 566 aa28.84■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 HSCBQ8IWL3 235 aa28.84■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 TTC22Q5TAA0 569 aa28.83■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 RGPD2P0DJD1 1756 aa28.83■■■□□ 2.21
EHD4-202ENST00000569223 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa28.82■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 FLIIQ13045 1269 aa28.82■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 KCNH5Q8NCM2 988 aa28.82■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 NBPF6Q5VWK0 638 aa28.81■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 SNX21Q969T3 373 aa28.81■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 NBPF4Q96M43 638 aa28.81■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 HMMRO75330 724 aa28.8■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.79■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 NECTIN2Q92692 538 aa28.79■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 KIF2CQ99661 725 aa28.79■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa28.77■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 LMO7Q8WWI1 1683 aa28.77■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 SLIT3O75094 1523 aa28.76■■■□□ 2.2
EHD4-202ENST00000569223 ZBTB7CA1YPR0 619 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 GNAI2P04899 355 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 KDM3BQ7LBC6 1761 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 APBB1O00213 710 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 ORAI2Q96SN7 254 aa28.76■■■□□ 2.19
EHD4-202ENST00000569223 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.75■■■□□ 2.19
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