RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564502.1

NPIPB13-205, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family, member B13, human

TSL 4

Gene NPIPB13, Length 543 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB13-205	ENST00000564502	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	USP6	P35125	1406 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	PSME1	Q06323	249 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	FYB1	O15117	783 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	SLAIN2	Q9P270	581 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	AKAP12	Q02952	1782 aa		13.58	□□□□□ -0.23
NPIPB13-205	ENST00000564502	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	FOXO3	O43524	673 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	JCAD	Q9P266	1359 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	SEC24B	O95487	1268 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	NME9	Q86XW9	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	COG3	Q96JB2	828 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	KIF1A	Q12756	1690 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	PPP2R1A	P30153	589 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	MRS2	Q9HD23	443 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	SSH2	Q76I76	1423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	ABTB2	Q8N961	1025 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB13-205	ENST00000564502	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	USP31	Q70CQ4	1352 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	GABBR2	O75899	941 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	GPR37	O15354	613 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	CCDC184	Q52MB2	194 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	CFAP53	Q96M91	514 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	SBNO1	A3KN83	1393 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	TRIM66	O15016	1216 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	TBC1D12	O60347	775 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	SLC39A7	Q92504	469 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	PTGER2	P43116	358 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	MTHFS	P49914	203 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	SHPRH	Q149N8	1683 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	EP400	Q96L91	3159 aa		13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	PDE4D	Q08499	809 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
NPIPB13-205	ENST00000564502	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	POLK	Q9UBT6	870 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	ARHGEF10	O15013	1369 aa		13.45	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	PIK3C2A	O00443	1686 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	PXDN	Q92626	1479 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	OSBP	P22059	807 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	RGS12	O14924	1447 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		13.44	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	C7	P10643	843 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	NUDC	Q9Y266	331 aa		13.43	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	FBLN1	P23142	703 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	RXRB	P28702	533 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.42	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	FCHSD2	O94868	740 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	GC	P02774	474 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	AMPH	P49418	695 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	HIC1	Q14526	733 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	DDX12P	Q92771	950 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.41	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	USP54	Q70EL1	1684 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	USP19	O94966	1318 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	GNPAT	O15228	680 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	EVI5	O60447	810 aa		13.4	□□□□□ -0.26
NPIPB13-205	ENST00000564502	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26

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