RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	RGPD1	P0DJD0	1748 aa		32.74	■■■□□ 2.83
TPCN1-222	ENST00000552897	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TPCN1-222	ENST00000552897	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TPCN1-222	ENST00000552897	SBF2	Q86WG5	1849 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TPCN1-222	ENST00000552897	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
TPCN1-222	ENST00000552897	KCNQ2	O43526	872 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TPCN1-222	ENST00000552897	APBA3	O96018	575 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TPCN1-222	ENST00000552897	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
TPCN1-222	ENST00000552897	BAG6	P46379	1132 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TPCN1-222	ENST00000552897	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TPCN1-222	ENST00000552897	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TPCN1-222	ENST00000552897	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
TPCN1-222	ENST00000552897	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	32.67	■■■□□ 2.82
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
TPCN1-222	ENST00000552897	CYP27B1	O15528	508 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TPCN1-222	ENST00000552897	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TPCN1-222	ENST00000552897	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TPCN1-222	ENST00000552897	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TPCN1-222	ENST00000552897	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TPCN1-222	ENST00000552897	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TPCN1-222	ENST00000552897	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TPCN1-222	ENST00000552897	KDR	P35968	1356 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TPCN1-222	ENST00000552897	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	32.61	■■■□□ 2.81
TPCN1-222	ENST00000552897	SPG7	Q9UQ90	795 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TPCN1-222	ENST00000552897	HMOX1	P09601	288 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TPCN1-222	ENST00000552897	NHS	Q6T4R5	1651 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	CFAP53	Q96M91	514 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	PLSCR1	O15162	318 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	RALBP1	Q15311	655 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	PHKG2	P15735	406 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.51	■■■□□ 2.8
TPCN1-222	ENST00000552897	PROM2	Q8N271	834 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TPCN1-222	ENST00000552897	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.51	■■■□□ 2.79
TPCN1-222	ENST00000552897	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TPCN1-222	ENST00000552897	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.49	■■■□□ 2.79
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.48	■■■□□ 2.79
TPCN1-222	ENST00000552897	BTAF1	O14981	1849 aa		32.47	■■■□□ 2.79
TPCN1-222	ENST00000552897	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TPCN1-222	ENST00000552897	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	RREB1	Q92766	1687 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	TXNRD1	Q16881	649 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.43	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.41	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.41	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	PIGB	Q92521	554 aa		32.39	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
TPCN1-222	ENST00000552897	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TPCN1-222	ENST00000552897	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TPCN1-222	ENST00000552897	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.37	■■■□□ 2.77
TPCN1-222	ENST00000552897	ITGB4	P16144	1822 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TPCN1-222	ENST00000552897	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.36	■■■□□ 2.77
TPCN1-222	ENST00000552897	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TPCN1-222	ENST00000552897	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
TPCN1-222	ENST00000552897	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		32.35	■■■□□ 2.77
TPCN1-222	ENST00000552897	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TPCN1-222	ENST00000552897	KCNQ4	P56696	695 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TPCN1-222	ENST00000552897	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
TPCN1-222	ENST00000552897	FCHSD2	O94868	740 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TPCN1-222	ENST00000552897	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
TPCN1-222	ENST00000552897	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TPCN1-222	ENST00000552897	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TPCN1-222	ENST00000552897	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TPCN1-222	ENST00000552897	NBPF14	Q5TI25	921 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TPCN1-222	ENST00000552897	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TPCN1-222	ENST00000552897	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.26	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	PALLD	Q8WX93	1383 aa		32.26	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	LY75	O60449	1722 aa		32.26	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	CABP4	P57796	275 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		32.23	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	32.22	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.22	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.21	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP3K5	Q99683	1374 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF827	Q17R98	1081 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	CCDC184	Q52MB2	194 aa		32.2	■■■□□ 2.75
TPCN1-222	ENST00000552897	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC15A2	Q16348	729 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TPCN1-222	ENST00000552897	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TPCN1-222	ENST00000552897	STK32B	Q9NY57	414 aa		32.18	■■■□□ 2.74
TPCN1-222	ENST00000552897	AKT1S1	Q96B36	256 aa		32.17	■■■□□ 2.74

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