RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551430.6

CS-226, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-226ENST00000551430 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CS-226ENST00000551430 PLSCR1O15162 318 aa28.59■■■□□ 2.17
CS-226ENST00000551430 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.59■■■□□ 2.17
CS-226ENST00000551430 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CS-226ENST00000551430 EYA1Q99502 592 aa28.58■■■□□ 2.17
CS-226ENST00000551430 NHSQ6T4R5 1651 aa28.58■■■□□ 2.16
CS-226ENST00000551430 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.57■■■□□ 2.16
CS-226ENST00000551430 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.57■■■□□ 2.16
CS-226ENST00000551430 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CS-226ENST00000551430 PROM2Q8N271 834 aa28.56■■■□□ 2.16
CS-226ENST00000551430 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CS-226ENST00000551430 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CS-226ENST00000551430 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa28.54■■■□□ 2.16
CS-226ENST00000551430 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CS-226ENST00000551430 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
CS-226ENST00000551430 CYP27B1O15528 508 aa28.48■■■□□ 2.15
CS-226ENST00000551430 TXNRD1Q16881 649 aa28.48■■■□□ 2.15
CS-226ENST00000551430 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.47■■■□□ 2.15
CS-226ENST00000551430 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CS-226ENST00000551430 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.46■■■□□ 2.15
CS-226ENST00000551430 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.46■■■□□ 2.15
CS-226ENST00000551430 BTAF1O14981 1849 aa28.46■■■□□ 2.15
CS-226ENST00000551430 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.46■■■□□ 2.15
CS-226ENST00000551430 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.44■■■□□ 2.14
CS-226ENST00000551430 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.44■■■□□ 2.14
CS-226ENST00000551430 NBPF14Q5TI25 921 aa28.43■■■□□ 2.14
CS-226ENST00000551430 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
CS-226ENST00000551430 KAT6BQ8WYB5 2073 aa28.41■■■□□ 2.14
CS-226ENST00000551430 IL13P35225 146 aa28.41■■■□□ 2.14
CS-226ENST00000551430 MTHFSP49914 203 aa28.41■■■□□ 2.14
CS-226ENST00000551430 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
CS-226ENST00000551430 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.4■■■□□ 2.14
CS-226ENST00000551430 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.142e-6■■□□□ 11.9
CS-226ENST00000551430 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.38■■■□□ 2.13
CS-226ENST00000551430 SPG7Q9UQ90 795 aa28.38■■■□□ 2.13
CS-226ENST00000551430 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
CS-226ENST00000551430 LRP5O75197 1615 aa28.36■■■□□ 2.13
CS-226ENST00000551430 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.35■■■□□ 2.13
CS-226ENST00000551430 PAPPAQ13219 1627 aa28.34■■■□□ 2.13
CS-226ENST00000551430 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.34■■■□□ 2.13
CS-226ENST00000551430 PHKG2P15735 406 aa28.33■■■□□ 2.13
CS-226ENST00000551430 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
CS-226ENST00000551430 KDRP35968 1356 aa28.33■■■□□ 2.13
CS-226ENST00000551430 KCNQ4P56696 695 aa28.32■■■□□ 2.12
CS-226ENST00000551430 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.32■■■□□ 2.12
CS-226ENST00000551430 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
CS-226ENST00000551430 SLC15A2Q16348 729 aa28.3■■■□□ 2.12
CS-226ENST00000551430 ZNF827Q17R98 1081 aa28.29■■■□□ 2.12
CS-226ENST00000551430 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.29■■■□□ 2.12
CS-226ENST00000551430 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.29■■■□□ 2.12
CS-226ENST00000551430 STK32BQ9NY57 414 aa28.29■■■□□ 2.12
CS-226ENST00000551430 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.28■■■□□ 2.12
CS-226ENST00000551430 PIGBQ92521 554 aa28.26■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 CASZ1Q86V15 1759 aa28.26■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 LY75O60449 1722 aa28.25■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 AKT1S1Q96B36 256 aa28.24■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 HMOX1P09601 288 aa28.23■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 PALLDQ8WX93 1383 aa28.23■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 ITGB4P16144 1822 aa28.22■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.22■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CS-226ENST00000551430 PPP2R1AP30153 589 aa28.2■■■□□ 2.1
CS-226ENST00000551430 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.19■■■□□ 2.1
CS-226ENST00000551430 ZBTB7AO95365 584 aa28.18■■■□□ 2.1
CS-226ENST00000551430 DCAF5Q96JK2 942 aa28.17■■■□□ 2.1
CS-226ENST00000551430 SPON1Q9HCB6 807 aa28.17■■■□□ 2.1
CS-226ENST00000551430 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.16■■■□□ 2.1
CS-226ENST00000551430 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CS-226ENST00000551430 ERVV-2B6SEH9 535 aa28.14■■■□□ 2.1
CS-226ENST00000551430 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CS-226ENST00000551430 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.13■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 ATG3Q9NT62 314 aa28.13■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.13■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 PTGER2P43116 358 aa28.11■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.1■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.09■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.09■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 SIK1P57059 783 aa28.09■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 C5P01031 1676 aa28.08■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.08■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 CFAP53Q96M91 514 aa28.08■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 MTFR1LQ9H019 292 aa28.08■■■□□ 2.09
CS-226ENST00000551430 CABP4P57796 275 aa28.07■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.07■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 ITPK1Q13572 414 aa28.06■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.06■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 SLC4A9Q96Q91 983 aa28.06■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 LGR6Q9HBX8 967 aa28.06■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.06■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.05■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.04■■■□□ 2.08
CS-226ENST00000551430 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms