RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550020.6

TMEM116-209, Transcript of transmembrane protein 116, human

TSL 4

Gene TMEM116, Length 572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM116-209	ENST00000550020	CRB1	P82279	1406 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	HMMR	O75330	724 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	HOXC9	P31274	260 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	EYA1	Q99502	592 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	PIK3C2A	O00443	1686 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	SOX12	O15370	315 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	MCM10	Q7L590	875 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	USP19	O94966	1318 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	PSME1	Q06323	249 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	MAP3K5	Q99683	1374 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	C14orf37	Q86TY3	774 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	IP6K1	Q92551	441 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	CASC1	Q6TDU7	716 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	LNPK	Q9C0E8	428 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TMEM116-209	ENST00000550020	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	SEC24B	O95487	1268 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	GNAI3	P08754	354 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	HOXB7	P09629	217 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	CDC45	O75419	566 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	NFKBIB	Q15653	356 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	HSCB	Q8IWL3	235 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	LRRC37A3	O60309	1634 aa		11.12	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	NCAPD2	Q15021	1401 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	NWD1	Q149M9	1564 aa		11.11	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	RGS12	O14924	1447 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	FOXO3	O43524	673 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	GNAI2	P04899	355 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	CEP85	Q6P2H3	762 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	MSH6	P52701	1360 aa		11.1	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	KIF1A	Q12756	1690 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	SNX21	Q969T3	373 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	NFAT5	O94916	1531 aa		11.09	□□□□□ -0.63
TMEM116-209	ENST00000550020	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	TEF	Q10587	303 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	FLII	Q13045	1269 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	IL27	Q8NEV9	243 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	SLIT3	O75094	1523 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	MST1R	Q04912	1400 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.08	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	KRT24	Q2M2I5	525 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	TTC22	Q5TAA0	569 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.07	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	GC	P02774	474 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	PTMS	P20962	102 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	GSE1	Q14687	1217 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	MEIS3	Q99687	375 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	DCC	P43146	1447 aa		11.06	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	REC8	O95072	547 aa		11.05	□□□□□ -0.64
TMEM116-209	ENST00000550020	ATF3	P18847	181 aa		11.05	□□□□□ -0.64

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