RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548847.1

SLC25A3-211, Transcript of solute carrier family 25 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC25A3, Length 1,369 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A3-211ENST00000548847 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC25A3-211ENST00000548847 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SLC25A3-211ENST00000548847 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC25A3-211ENST00000548847 KCNQ2O43526 872 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC25A3-211ENST00000548847 RREB1Q92766 1687 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC25A3-211ENST00000548847 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SLC25A3-211ENST00000548847 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC25A3-211ENST00000548847 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SLC25A3-211ENST00000548847 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC25A3-211ENST00000548847 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC25A3-211ENST00000548847 PKD1L3Q7Z443 1732 aa26.08■■□□□ 1.77
SLC25A3-211ENST00000548847 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.07■■□□□ 1.76
SLC25A3-211ENST00000548847 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC25A3-211ENST00000548847 PLSCR1O15162 318 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC25A3-211ENST00000548847 MTHFSP49914 203 aa26.05■■□□□ 1.76
SLC25A3-211ENST00000548847 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SLC25A3-211ENST00000548847 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.03■■□□□ 1.76
SLC25A3-211ENST00000548847 BTAF1O14981 1849 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC25A3-211ENST00000548847 IL13P35225 146 aa26.02■■□□□ 1.76
SLC25A3-211ENST00000548847 CYP27B1O15528 508 aa26.01■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.01■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.01■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.01■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 PROM2Q8N271 834 aa26■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.98■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.98■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 KDRP35968 1356 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
SLC25A3-211ENST00000548847 SPG7Q9UQ90 795 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC25A3-211ENST00000548847 TXNRD1Q16881 649 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC25A3-211ENST00000548847 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SLC25A3-211ENST00000548847 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SLC25A3-211ENST00000548847 SULT6B1Q6IMI4 303 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC25A3-211ENST00000548847 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SLC25A3-211ENST00000548847 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SLC25A3-211ENST00000548847 PHKG2P15735 406 aa25.9■■□□□ 1.74
SLC25A3-211ENST00000548847 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SLC25A3-211ENST00000548847 PPP2R1AP30153 589 aa25.89■■□□□ 1.74
SLC25A3-211ENST00000548847 ITGB4P16144 1822 aa25.87■■□□□ 1.73
SLC25A3-211ENST00000548847 NBPF14Q5TI25 921 aa25.87■■□□□ 1.73
SLC25A3-211ENST00000548847 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.87■■□□□ 1.73
SLC25A3-211ENST00000548847 PAPPAQ13219 1627 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A3-211ENST00000548847 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SLC25A3-211ENST00000548847 LY75O60449 1722 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A3-211ENST00000548847 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SLC25A3-211ENST00000548847 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.85■■□□□ 1.73
SLC25A3-211ENST00000548847 HMOX1P09601 288 aa25.84■■□□□ 1.73
SLC25A3-211ENST00000548847 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.83■■□□□ 1.73
SLC25A3-211ENST00000548847 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.82■■□□□ 1.72
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SLC25A3-211ENST00000548847 PIGBQ92521 554 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A3-211ENST00000548847 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SLC25A3-211ENST00000548847 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.79■■□□□ 1.72
SLC25A3-211ENST00000548847 CFAP53Q96M91 514 aa25.79■■□□□ 1.72
SLC25A3-211ENST00000548847 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
SLC25A3-211ENST00000548847 KCNQ4P56696 695 aa25.78■■□□□ 1.72
SLC25A3-211ENST00000548847 LRP5O75197 1615 aa25.78■■□□□ 1.72
SLC25A3-211ENST00000548847 SLC15A2Q16348 729 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A3-211ENST00000548847 DCAF5Q96JK2 942 aa25.77■■□□□ 1.72
SLC25A3-211ENST00000548847 CASZ1Q86V15 1759 aa25.76■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 PALLDQ8WX93 1383 aa25.76■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 ZNF827Q17R98 1081 aa25.75■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 STK32BQ9NY57 414 aa25.75■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.75■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.74■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.73■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 AKT1S1Q96B36 256 aa25.72■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.71■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.71■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 RALBP1Q15311 655 aa25.7■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.7■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.7■■□□□ 1.71
SLC25A3-211ENST00000548847 ATG3Q9NT62 314 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 NUDCQ9Y266 331 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 C5P01031 1676 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.69■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.68■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.67■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 PRKAR2BP31323 418 aa25.67■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.77e-9■□□□□ 8.6
SLC25A3-211ENST00000548847 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 CABP4P57796 275 aa25.66■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.66■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 LGR6Q9HBX8 967 aa25.66■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 MRC1P22897 1456 aa25.65■■□□□ 1.7
SLC25A3-211ENST00000548847 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.64■■□□□ 1.69
SLC25A3-211ENST00000548847 SIK1P57059 783 aa25.64■■□□□ 1.69
SLC25A3-211ENST00000548847 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.64■■□□□ 1.69
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