RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547283.5

CS-207, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-207ENST00000547283 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
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CS-207ENST00000547283 SHANK3Q9BYB0 1731 aa28.59■■■□□ 2.17
CS-207ENST00000547283 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CS-207ENST00000547283 EYA1Q99502 592 aa28.58■■■□□ 2.17
CS-207ENST00000547283 NHSQ6T4R5 1651 aa28.58■■■□□ 2.16
CS-207ENST00000547283 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.57■■■□□ 2.16
CS-207ENST00000547283 NUP188Q5SRE5 1749 aa28.57■■■□□ 2.16
CS-207ENST00000547283 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
CS-207ENST00000547283 PROM2Q8N271 834 aa28.56■■■□□ 2.16
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CS-207ENST00000547283 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.47■■■□□ 2.15
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CS-207ENST00000547283 IL13P35225 146 aa28.41■■■□□ 2.14
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CS-207ENST00000547283 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
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CS-207ENST00000547283 LRP5O75197 1615 aa28.36■■■□□ 2.13
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CS-207ENST00000547283 KDRP35968 1356 aa28.33■■■□□ 2.13
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CS-207ENST00000547283 ZNF827Q17R98 1081 aa28.29■■■□□ 2.12
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CS-207ENST00000547283 ATG3Q9NT62 314 aa28.13■■■□□ 2.09
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CS-207ENST00000547283 PTGER2P43116 358 aa28.11■■■□□ 2.09
CS-207ENST00000547283 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CS-207ENST00000547283 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
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CS-207ENST00000547283 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.09■■■□□ 2.09
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CS-207ENST00000547283 LINC00116Q8NCU8 138 aa28.05■■■□□ 2.08
CS-207ENST00000547283 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.04■■■□□ 2.08
CS-207ENST00000547283 RSPH6AQ9H0K4 717 aa28.04■■■□□ 2.08
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