RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 IL13P35225 146 aa24.85■■□□□ 1.57
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COPS7A-216ENST00000543170 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.78■■□□□ 1.56
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COPS7A-216ENST00000543170 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
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COPS7A-216ENST00000543170 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.7■■□□□ 1.54
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COPS7A-216ENST00000543170 APBA3O96018 575 aa24.68■■□□□ 1.54
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COPS7A-216ENST00000543170 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.67■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
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COPS7A-216ENST00000543170 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.66■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 PLSCR1O15162 318 aa24.65■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 HMOX1P09601 288 aa24.65■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 PHKG2P15735 406 aa24.65■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 ACSBG1Q96GR2 724 aa24.65■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 KCNQ2O43526 872 aa24.64■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.64■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 CAMKK2Q96RR4 588 aa24.64■■□□□ 1.54
COPS7A-216ENST00000543170 ITGB4P16144 1822 aa24.63■■□□□ 1.53
COPS7A-216ENST00000543170 NUP188Q5SRE5 1749 aa24.63■■□□□ 1.53
COPS7A-216ENST00000543170 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
COPS7A-216ENST00000543170 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
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COPS7A-216ENST00000543170 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.53
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COPS7A-216ENST00000543170 LY75O60449 1722 aa24.58■■□□□ 1.52
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COPS7A-216ENST00000543170 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
COPS7A-216ENST00000543170 PRKAR2BP31323 418 aa24.54■■□□□ 1.52
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COPS7A-216ENST00000543170 MRC1P22897 1456 aa24.52■■□□□ 1.52
COPS7A-216ENST00000543170 ERVV-2B6SEH9 535 aa24.52■■□□□ 1.52
COPS7A-216ENST00000543170 PAPPAQ13219 1627 aa24.51■■□□□ 1.51
COPS7A-216ENST00000543170 ANP32CO43423 234 aa24.5■■□□□ 1.51
COPS7A-216ENST00000543170 TXNRD1Q16881 649 aa24.5■■□□□ 1.51
COPS7A-216ENST00000543170 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.49■■□□□ 1.51
COPS7A-216ENST00000543170 PROM2Q8N271 834 aa24.49■■□□□ 1.51
COPS7A-216ENST00000543170 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.49■■□□□ 1.51
COPS7A-216ENST00000543170 MAP3K5Q99683 1374 aa24.49■■□□□ 1.51
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COPS7A-216ENST00000543170 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
COPS7A-216ENST00000543170 SLC27A3Q5K4L6 730 aa24.47■■□□□ 1.51
COPS7A-216ENST00000543170 PHACTR3Q96KR7 559 aa24.47■■□□□ 1.51
COPS7A-216ENST00000543170 PALLDQ8WX93 1383 aa24.46■■□□□ 1.51
COPS7A-216ENST00000543170 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
COPS7A-216ENST00000543170 PLEKHF1Q96S99 279 aa24.45■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.44■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 NEFMP07197 916 aa24.44■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.43■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 CABP4P57796 275 aa24.43■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 NBPF14Q5TI25 921 aa24.43■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.42■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 C5P01031 1676 aa24.42■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.42■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.42■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.41■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 LGR6Q9HBX8 967 aa24.4■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 LRRC4BQ9NT99 713 aa24.4■■□□□ 1.5
COPS7A-216ENST00000543170 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
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