RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 APBA3O96018 575 aa29.7■■■□□ 2.35
PTPRK-222ENST00000532751 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.69■■■□□ 2.34
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PTPRK-222ENST00000532751 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
PTPRK-222ENST00000532751 PKD1L3Q7Z443 1732 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRK-222ENST00000532751 NHSQ6T4R5 1651 aa29.66■■■□□ 2.34
PTPRK-222ENST00000532751 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
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PTPRK-222ENST00000532751 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRK-222ENST00000532751 IL13P35225 146 aa29.64■■■□□ 2.34
PTPRK-222ENST00000532751 ACSBG1Q96GR2 724 aa29.63■■■□□ 2.33
PTPRK-222ENST00000532751 SPG7Q9UQ90 795 aa29.63■■■□□ 2.33
PTPRK-222ENST00000532751 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.63■■■□□ 2.33
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PTPRK-222ENST00000532751 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa29.61■■■□□ 2.33
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PTPRK-222ENST00000532751 PPP2R1AP30153 589 aa29.58■■■□□ 2.33
PTPRK-222ENST00000532751 PLSCR1O15162 318 aa29.57■■■□□ 2.32
PTPRK-222ENST00000532751 SULT6B1Q6IMI4 303 aa29.57■■■□□ 2.32
PTPRK-222ENST00000532751 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.57■■■□□ 2.32
PTPRK-222ENST00000532751 RREB1Q92766 1687 aa29.56■■■□□ 2.32
PTPRK-222ENST00000532751 BTAF1O14981 1849 aa29.56■■■□□ 2.32
PTPRK-222ENST00000532751 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PTPRK-222ENST00000532751 CYP27B1O15528 508 aa29.55■■■□□ 2.32
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PTPRK-222ENST00000532751 AEBP1Q8IUX7 1158 aa29.54■■■□□ 2.32
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PTPRK-222ENST00000532751 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
PTPRK-222ENST00000532751 AMOTQ4VCS5 1084 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRK-222ENST00000532751 IFNL2Q8IZJ0 200 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRK-222ENST00000532751 NUP188Q5SRE5 1749 aa29.51■■■□□ 2.31
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PTPRK-222ENST00000532751 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PTPRK-222ENST00000532751 RALBP1Q15311 655 aa29.49■■■□□ 2.31
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PTPRK-222ENST00000532751 PHKG2P15735 406 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRK-222ENST00000532751 ITGB4P16144 1822 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRK-222ENST00000532751 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa29.45■■■□□ 2.31
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
PTPRK-222ENST00000532751 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PTPRK-222ENST00000532751 NBPF14Q5TI25 921 aa29.44■■■□□ 2.3
PTPRK-222ENST00000532751 TXNRD1Q16881 649 aa29.43■■■□□ 2.3
PTPRK-222ENST00000532751 C1orf141Q5JVX7 400 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRK-222ENST00000532751 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa29.4■■■□□ 2.3
PTPRK-222ENST00000532751 PROM2Q8N271 834 aa29.39■■■□□ 2.3
PTPRK-222ENST00000532751 LY75O60449 1722 aa29.38■■■□□ 2.29
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PTPRK-222ENST00000532751 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
PTPRK-222ENST00000532751 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
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PTPRK-222ENST00000532751 TMOD3Q9NYL9 352 aa29.35■■■□□ 2.29
PTPRK-222ENST00000532751 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
PTPRK-222ENST00000532751 AKAP4Q5JQC9 854 aa29.34■■■□□ 2.29
PTPRK-222ENST00000532751 ERVV-2B6SEH9 535 aa29.33■■■□□ 2.29
PTPRK-222ENST00000532751 SLC27A3Q5K4L6 730 aa29.33■■■□□ 2.29
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PTPRK-222ENST00000532751 PIGBQ92521 554 aa29.32■■■□□ 2.28
PTPRK-222ENST00000532751 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
PTPRK-222ENST00000532751 RSPH6AQ9H0K4 717 aa29.31■■■□□ 2.28
PTPRK-222ENST00000532751 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
PTPRK-222ENST00000532751 FCHSD2O94868 740 aa29.3■■■□□ 2.28
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PTPRK-222ENST00000532751 GAS2L2Q8NHY3 880 aa29.3■■■□□ 2.28
PTPRK-222ENST00000532751 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
PTPRK-222ENST00000532751 STK32BQ9NY57 414 aa29.29■■■□□ 2.28
PTPRK-222ENST00000532751 PALLDQ8WX93 1383 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPRK-222ENST00000532751 CABP4P57796 275 aa29.28■■■□□ 2.28
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PTPRK-222ENST00000532751 PAPPAQ13219 1627 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPRK-222ENST00000532751 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC4BQ9NT99 713 aa29.26■■■□□ 2.27
PTPRK-222ENST00000532751 NEFMP07197 916 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPRK-222ENST00000532751 SLC15A2Q16348 729 aa29.24■■■□□ 2.27
PTPRK-222ENST00000532751 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
PTPRK-222ENST00000532751 RNMTO43148 476 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
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PTPRK-222ENST00000532751 ASAP1Q9ULH1 1129 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRK-222ENST00000532751 MAP3K5Q99683 1374 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRK-222ENST00000532751 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa29.21■■■□□ 2.27
PTPRK-222ENST00000532751 TAF1LQ8IZX4 1826 aa29.2■■■□□ 2.27
PTPRK-222ENST00000532751 GNAT3A8MTJ3 354 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRK-222ENST00000532751 KCNQ4P56696 695 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRK-222ENST00000532751 C5P01031 1676 aa29.2■■■□□ 2.26
PTPRK-222ENST00000532751 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa29.19■■■□□ 2.26
PTPRK-222ENST00000532751 LGR6Q9HBX8 967 aa29.19■■■□□ 2.26
PTPRK-222ENST00000532751 ATG3Q9NT62 314 aa29.19■■■□□ 2.26
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