RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530500.5

ATG13-216, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

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Gene ATG13, Length 2,030 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-216ENST00000530500 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
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ATG13-216ENST00000530500 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 ABTB2Q8N961 1025 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 BCL11AQ9H165 835 aa20.29■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 PTPRCP08575 1304 aa20.28■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 HOXC9P31274 260 aa20.27■□□□□ 0.84
ATG13-216ENST00000530500 PHF8Q9UPP1 1060 aa20.27■□□□□ 0.84
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ATG13-216ENST00000530500 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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ATG13-216ENST00000530500 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.24■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 ANKRD45Q5TZF3 282 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.23■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 FOXO3O43524 673 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 KRT24Q2M2I5 525 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.22■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 RGS12O14924 1447 aa20.21■□□□□ 0.83
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ATG13-216ENST00000530500 NUTM2GQ5VZR2 741 aa20.2■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 C22orf23Q9BZE7 217 aa20.2■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 BABAM1Q9NWV8 329 aa20.2■□□□□ 0.83
ATG13-216ENST00000530500 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 SLC4A2P04920 1241 aa20.19■□□□□ 0.82
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ATG13-216ENST00000530500 NWD1Q149M9 1564 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 C14orf37Q86TY3 774 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 LRRC37A3O60309 1634 aa20.19■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 KCNH5Q8NCM2 988 aa20.18■□□□□ 0.82
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ATG13-216ENST00000530500 PSME1Q06323 249 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 IP6K1Q92551 441 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 DCTPP1Q9H773 170 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 MIS18AQ9NYP9 233 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 MAP3K5Q99683 1374 aa20.17■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 LTN1O94822 1766 aa20.16■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 ESCO1Q5FWF5 840 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 STK31Q9BXU1 1019 aa20.15■□□□□ 0.82
ATG13-216ENST00000530500 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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ATG13-216ENST00000530500 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG13-216ENST00000530500 NFAT5O94916 1531 aa20.14■□□□□ 0.81
ATG13-216ENST00000530500 MSH6P52701 1360 aa20.13■□□□□ 0.81
ATG13-216ENST00000530500 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ATG13-216ENST00000530500 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
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ATG13-216ENST00000530500 ATP10DQ9P241 1426 aa20.13■□□□□ 0.81
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ATG13-216ENST00000530500 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.05■□□□□ 0.8
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ATG13-216ENST00000530500 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
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ATG13-216ENST00000530500 GSE1Q14687 1217 aa20.02■□□□□ 0.79
ATG13-216ENST00000530500 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.02■□□□□ 0.79
ATG13-216ENST00000530500 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
ATG13-216ENST00000530500 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
ATG13-216ENST00000530500 KIF1AQ12756 1690 aa20.01■□□□□ 0.79
ATG13-216ENST00000530500 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
ATG13-216ENST00000530500 NCAPD2Q15021 1401 aa20■□□□□ 0.79
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