RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530392.1

TATDN3-210, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

TSL 4

Gene TATDN3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-210ENST00000530392 VEGFBP49765 207 aa6.86□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 SKOR1P84550 965 aa6.86□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 CTDSPL2Q05D32 466 aa6.86□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 Q3C1V9 767 aa6.86□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.86□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.86□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 IGSF5Q9NSI5 407 aa6.86□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 ATP9BO43861 1147 aa6.85□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 ALDH1A1P00352 501 aa6.85□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 CCDC125Q86Z20 511 aa6.85□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 CEP164Q9UPV0 1460 aa6.85□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 CHD1O14646 1710 aa6.84□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 KDM4AO75164 1064 aa6.84□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 FDX1P10109 184 aa6.84□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 BMP1P13497 986 aa6.84□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 WNT7BP56706 349 aa6.84□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.84□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.84□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.84□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 TRIM34Q9BYJ4 488 aa6.84□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
TATDN3-210ENST00000530392 H3BM21 787 aa6.83□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 TRIM46Q7Z4K8 759 aa6.83□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.83□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.83□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 CHMP4AQ9BY43 222 aa6.83□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 ERBB4Q15303 1308 aa6.82□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 USP46P62068 366 aa6.82□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 STK32AQ8WU08 396 aa6.82□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 SOWAHDA6NJG2 315 aa6.8□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 MTMR2Q13614 643 aa6.8□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.8□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 ANKRD33BA6NCL7 494 aa6.79□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 SIAH2O43255 324 aa6.79□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 C8orf37Q96NL8 207 aa6.79□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.79□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.79□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.79□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 C6orf229H3BNL8 230 aa6.78□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 HOXA2O43364 376 aa6.78□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 GPR37L1O60883 481 aa6.78□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 SKIP12755 728 aa6.78□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.78□□□□□ -1.32
TATDN3-210ENST00000530392 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L3A6NCW0 530 aa6.77□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L4A6NCW7 530 aa6.77□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 SSFA2P28290 1259 aa6.77□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 SERPINB4P48594 390 aa6.77□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.77□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.77□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.77□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.77□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 EPS8L1Q8TE68 723 aa6.77□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 ZFP42Q96MM3 310 aa6.77□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 ATP2B4P23634 1241 aa6.76□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 GUCA2AQ02747 115 aa6.76□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 NR6A1Q15406 480 aa6.76□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.76□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 UBXN4Q92575 508 aa6.76□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 HLA-CQ95604 372 aa6.76□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 SPATA32Q96LK8 384 aa6.76□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L5A8MUK1 530 aa6.75□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 ABL1P00519 1130 aa6.75□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.75□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 FAM196BA6NMK8 535 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L15C9J2P7 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L10C9JJH3 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L12C9JPN9 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L11C9JVI0 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L21D6R901 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L18D6R9N7 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L22D6RA61 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L19D6RCP7 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L20D6RJB6 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 JUNDP17535 347 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 RASA1P20936 1047 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 USP17L24Q0WX57 530 aa6.74□□□□□ -1.33
TATDN3-210ENST00000530392 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms