RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523555.5

PABPC1-222, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 3

Gene PABPC1, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-222	ENST00000523555	NSD2	O96028	1365 aa		13.08	□□□□□ -0.31
PABPC1-222	ENST00000523555	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		13.08	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		13.07	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	ITGB4	P16144	1822 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	MORC1	Q86VD1	984 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	EYA1	Q99502	592 aa		13.05	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	PROM2	Q8N271	834 aa		13.04	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	13.03	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		13.03	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	LY75	O60449	1722 aa		13.02	□□□□□ -0.32
PABPC1-222	ENST00000523555	PLSCR1	O15162	318 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		13.02	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	PAPPA	Q13219	1627 aa		13.01	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		13	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	CYP27B1	O15528	508 aa		13	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	LRP5	O75197	1615 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	CASZ1	Q86V15	1759 aa		12.99	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	MTHFS	P49914	203 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	TXNRD1	Q16881	649 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		12.98	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	IL13	P35225	146 aa		12.97	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	12.97	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		12.96	□□□□□ -0.33
PABPC1-222	ENST00000523555	KCNQ4	P56696	695 aa		12.95	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	KDR	P35968	1356 aa		12.94	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	C5	P01031	1676 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	PHKG2	P15735	406 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	NBPF14	Q5TI25	921 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		12.93	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	12.92	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF827	Q17R98	1081 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	SPG7	Q9UQ90	795 aa		12.92	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	12.91	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	HMOX1	P09601	288 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		12.91	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	12.91	□□□□□ -0.34	2e-23	■□□□□ 9.5
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC15A2	Q16348	729 aa		12.9	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		12.9	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	PIGB	Q92521	554 aa		12.9	□□□□□ -0.34
PABPC1-222	ENST00000523555	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	12.89	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	PPP2R1A	P30153	589 aa		12.89	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	12.88	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	AKT1S1	Q96B36	256 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	STK32B	Q9NY57	414 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	PALLD	Q8WX93	1383 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		12.88	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	C4B	P0C0L5	1744 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		12.87	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	ZBTB7A	O95365	584 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		12.86	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		12.85	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	ATG3	Q9NT62	314 aa		12.84	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
PABPC1-222	ENST00000523555	TJP1	Q07157	1748 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	SMIM5	Q71RC9	77 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	DCAF5	Q96JK2	942 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		12.83	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	PTGER2	P43116	358 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	LGR6	Q9HBX8	967 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	MRC1	P22897	1456 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PABPC1-222	ENST00000523555	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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