RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522193.1

HOXA-AS2-208, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2

Gene HOXA-AS2, Length 339 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-208ENST00000522193 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-208ENST00000522193 RREB1Q92766 1687 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-208ENST00000522193 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-208ENST00000522193 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-208ENST00000522193 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-208ENST00000522193 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.36■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-208ENST00000522193 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MTHFSP49914 203 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-208ENST00000522193 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXA-AS2-208ENST00000522193 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.33■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 BTAF1O14981 1849 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ACSBG1Q96GR2 724 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KCNQ2O43526 872 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CAMKK2Q96RR4 588 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 IL13P35225 146 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SPG7Q9UQ90 795 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CYP27B1O15528 508 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KDRP35968 1356 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PLSCR1O15162 318 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-208ENST00000522193 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PPP2R1AP30153 589 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-208ENST00000522193 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ITGB4P16144 1822 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CFAP53Q96M91 514 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXA-AS2-208ENST00000522193 HMOX1P09601 288 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PHKG2P15735 406 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 LY75O60449 1722 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 TXNRD1Q16881 649 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PROM2Q8N271 834 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PAPPAQ13219 1627 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 NBPF14Q5TI25 921 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 RALBP1Q15311 655 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 DCAF5Q96JK2 942 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 NUDCQ9Y266 331 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PIGBQ92521 554 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PALLDQ8WX93 1383 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.09■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 C5P01031 1676 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.08■□□□□ 0.81
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CASZ1Q86V15 1759 aa20.08■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 LRP5O75197 1615 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PRKAR2BP31323 418 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 KCNQ4P56696 695 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 STK32BQ9NY57 414 aa20.07■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa20.06■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MRC1P22897 1456 aa20.05■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 SLC15A2Q16348 729 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 QSER1Q2KHR3 1735 aa20.04■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 CABP4P57796 275 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 ZNF827Q17R98 1081 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 MAP3K5Q99683 1374 aa20.03■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 FCHSD2O94868 740 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.02■□□□□ 0.8
HOXA-AS2-208ENST00000522193 AKT1S1Q96B36 256 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms