RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 EYA1Q99502 592 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0G2JS52 829 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 SLC4A2P04920 1241 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.77□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 CNPY4Q8N129 248 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 CD163L1Q9NR16 1453 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 USP6P35125 1406 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 FLT4P35916 1363 aa9.76□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 DLC1Q96QB1 1528 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 VAMP4O75379 141 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM51Q9NW97 253 aa9.75□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF428Q96B54 188 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 PTPRUQ92729 1446 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 CLCN1P35523 988 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 AATKQ6ZMQ8 1374 aa9.74□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 TPM2P07951 284 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 HOXC9P31274 260 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 CPS1P31327 1500 aa9.73□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 BECN1Q14457 450 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 TECPR2O15040 1411 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 KDM2BQ8NHM5 1336 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 F6X3S4 739 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 GCP02774 474 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 C19orf44Q9H6X5 657 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 MED14O60244 1454 aa9.72□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 SBNO1A3KN83 1393 aa9.71□□□□□ -0.85
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 RGS22Q8NE09 1264 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 MAP7D2Q96T17 732 aa9.71□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC30Q5VVM6 783 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 CHRNA2Q15822 529 aa9.7□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 HMMRO75330 724 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD24Q8TF21 1146 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.69□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 CLGNO14967 610 aa9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 IP6K1Q92551 441 aa9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 NBPF4Q96M43 638 aa9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 KCNG1Q9UIX4 513 aa9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 PIK3R4Q99570 1358 aa9.68□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 CHL1O00533 1208 aa9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 BTBD11A6QL63 1104 aa9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 EVA1CP58658 441 aa9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 IQSEC2Q5JU85 1478 aa9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 VGLL3A8MV65 326 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 ANXA1P04083 346 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 CHD1LQ86WJ1 897 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 STRN4Q9NRL3 753 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 USP32Q8NFA0 1604 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 C8orf34Q49A92 452 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 C3P01024 1663 aa9.66□□□□□ -0.86
TRPS1-208ENST00000519076 PTCH1Q13635 1447 aa9.66□□□□□ -0.86
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