RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 FBXO45P0C2W1 286 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLURP2P0DP57 97 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAP3K10Q02779 954 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL27Q8NEV9 243 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 NLRP3Q96P20 1036 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 GOPCQ9HD26 462 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RNU6-277P-201ENST00000516272 IRS1P35568 1242 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 GSK3AP49840 483 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 RNF20Q5VTR2 975 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1W2PRU2 124 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPR25O00155 361 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGEF15O94989 841 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CCDC125Q86Z20 511 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF592Q92610 1267 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPC1P35052 558 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 POU4F2Q12837 409 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAS6Q14393 721 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRIM22Q8IYM9 498 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ERVK-9P63128 1117 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 NR1H3Q13133 447 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 H7C1W4 665 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 GMCL1Q96IK5 515 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 MBIPQ9NS73 344 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 DYRK1BQ9Y463 629 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCTRP47872 440 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 DBN1Q16643 649 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 KANK3Q6NY19 840 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 NBPF15Q8N660 670 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGF1RP08069 1367 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLN3Q13286 438 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 APBB1O00213 710 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 PODNQ7Z5L7 613 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 MX2P20592 715 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 BANK1Q8NDB2 785 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 GPAMQ9HCL2 828 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHF20L1A8MW92 1017 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAK2O60296 914 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 F11P03951 625 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 BCRP11274 1271 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 PHKA2P46019 1235 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 MTMR14Q8NCE2 650 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNKSR1Q969H4 720 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNRH1P01148 92 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHA1P01876 353 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 FOXK2Q01167 660 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 WDR44Q5JSH3 913 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNRKQ9NRH2 765 aa7.09□□□□□ -1.27
RNU6-277P-201ENST00000516272 CENPCQ03188 943 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 ACDQ96AP0 544 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC24A1O60721 1099 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 GNASQ5JWF2 1037 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms