RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513095.5

SH3BP2-226, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-226ENST00000513095 PPP2R1AP30153 589 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 DEFB132Q7Z7B7 95 aa19.12■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 PKD1L3Q7Z443 1732 aa19.1■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 BAG6P46379 1132 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 PTF1AQ7RTS3 328 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.09■□□□□ 0.65
SH3BP2-226ENST00000513095 APBA3O96018 575 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 KDRP35968 1356 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 ACSBG1Q96GR2 724 aa19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP19.07■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 NHSQ6T4R5 1651 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 CYP27B1O15528 508 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 KCNQ2O43526 872 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 CFAP53Q96M91 514 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 SPG7Q9UQ90 795 aa19.06■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 RALBP1Q15311 655 aa19.05■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 HMOX1P09601 288 aa19.04■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 CAMKK2Q96RR4 588 aa19.03■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
SH3BP2-226ENST00000513095 BTAF1O14981 1849 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 PHKG2P15735 406 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 AMOTQ4VCS5 1084 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 IFNL2Q8IZJ0 200 aa19■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 PLSCR1O15162 318 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 NUDCQ9Y266 331 aa18.99■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 RREB1Q92766 1687 aa18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
SH3BP2-226ENST00000513095 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 PROM2Q8N271 834 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 ITGB4P16144 1822 aa18.95■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 NUP188Q5SRE5 1749 aa18.94■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 TXNRD1Q16881 649 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa18.93■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 PRKAR2BP31323 418 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 DCAF5Q96JK2 942 aa18.92■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 FCHSD2O94868 740 aa18.91■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 AKAP4Q5JQC9 854 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 PIGBQ92521 554 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 PHACTR3Q96KR7 559 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP2-226ENST00000513095 ERVV-2B6SEH9 535 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 TMOD3Q9NYL9 352 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 LY75O60449 1722 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 SCN11AQ9UI33 1791 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 NBPF14Q5TI25 921 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 LRRC4BQ9NT99 713 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 CABP4P57796 275 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 LGR6Q9HBX8 967 aa18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 PALLDQ8WX93 1383 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa18.84■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 MAP3K5Q99683 1374 aa18.83■□□□□ 0.61
SH3BP2-226ENST00000513095 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 ANP32CO43423 234 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 KCNQ4P56696 695 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.83■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 PAPPAQ13219 1627 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 ATG3Q9NT62 314 aa18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.81■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 MRC1P22897 1456 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 IL17REQ8NFR9 667 aa18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
SH3BP2-226ENST00000513095 STK32BQ9NY57 414 aa18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms