RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
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SH3BP2-225ENST00000513069 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-225ENST00000513069 RGPD1P0DJD0 1748 aa20.64■□□□□ 0.89
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SH3BP2-225ENST00000513069 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-225ENST00000513069 SBF2Q86WG5 1849 aa20.61■□□□□ 0.89
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SH3BP2-225ENST00000513069 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.54■□□□□ 0.88
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SH3BP2-225ENST00000513069 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP2-225ENST00000513069 BTAF1O14981 1849 aa20.45■□□□□ 0.86
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SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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SH3BP2-225ENST00000513069 NUDCQ9Y266 331 aa20.38■□□□□ 0.85
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SH3BP2-225ENST00000513069 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
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SH3BP2-225ENST00000513069 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.37■□□□□ 0.85
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SH3BP2-225ENST00000513069 SLC27A3Q5K4L6 730 aa20.36■□□□□ 0.85
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SH3BP2-225ENST00000513069 ITGB4P16144 1822 aa20.35■□□□□ 0.85
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SH3BP2-225ENST00000513069 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP2-225ENST00000513069 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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SH3BP2-225ENST00000513069 PALLDQ8WX93 1383 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC15A2Q16348 729 aa20.33■□□□□ 0.85
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SH3BP2-225ENST00000513069 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 AKT1S1Q96B36 256 aa20.32■□□□□ 0.84
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SH3BP2-225ENST00000513069 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 LY75O60449 1722 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 CABP4P57796 275 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 STK32BQ9NY57 414 aa20.3■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 IL17REQ8NFR9 667 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 PLEKHF1Q96S99 279 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP2-225ENST00000513069 SIK1P57059 783 aa20.27■□□□□ 0.84
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