RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 GGNBP2Q9H3C7 697 aa15.58■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 MTFR1LQ9H019 292 aa15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.57■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 FYB1O15117 783 aa15.56■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC4BQ9NT99 713 aa15.56■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 WASHC2AQ641Q2 1341 aa15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF827Q17R98 1081 aa15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 RTL1A6NKG5 1358 aa15.54■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.54■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 MYOM1P52179 1685 aa15.54■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 KCNQ4P56696 695 aa15.53■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.53■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.53■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 NBPF4Q96M43 638 aa15.53■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 SYT17Q9BSW7 474 aa15.53■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 MEGF6O75095 1541 aa15.53■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.52■□□□□ 0.08
UBE2B-208ENST00000511807 BTAF1O14981 1849 aa15.52■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 PAPPAQ13219 1627 aa15.51■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 AKT1S1Q96B36 256 aa15.51■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 ARXQ96QS3 562 aa15.51■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.51■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa15.5■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.49■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 NSD2O96028 1365 aa15.49■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 INSRP06213 1382 aa15.49■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CGNL1Q0VF96 1302 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 KLHL34Q8N239 644 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 FLT4P35916 1363 aa15.48■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 NSD3Q9BZ95 1437 aa15.47■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 POLD1P28340 1107 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa15.46■□□□□ 0.07
UBE2B-208ENST00000511807 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.46■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.44■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.44■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.44■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 RGPD2P0DJD1 1756 aa15.44■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 PANK3Q9H999 370 aa15.43■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 MAP3K5Q99683 1374 aa15.42■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 GPR162Q16538 588 aa15.42■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.42■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.42■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.41■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 CYP27B1O15528 508 aa15.41■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 KIF20BQ96Q89 1820 aa15.4■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 PALLDQ8WX93 1383 aa15.4■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.39■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 MSL1Q68DK7 614 aa15.38■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 SPG7Q9UQ90 795 aa15.38■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 LY75O60449 1722 aa15.37■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 NLGN2Q8NFZ4 835 aa15.37■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 EYA1Q99502 592 aa15.37■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 POLKQ9UBT6 870 aa15.36■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 QSER1Q2KHR3 1735 aa15.35■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 PIGBQ92521 554 aa15.35■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 NCAPD2Q15021 1401 aa15.34■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 FLAD1Q8NFF5 587 aa15.34■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 AK7Q96M32 723 aa15.34■□□□□ 0.05
UBE2B-208ENST00000511807 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa15.33■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 PHF14O94880 888 aa15.32■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.32■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 ANP32CO43423 234 aa15.31■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 PHKG2P15735 406 aa15.31■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM5Q71RC9 77 aa15.31■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.31■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.31■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.3■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 C5P01031 1676 aa15.3■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 SIK1P57059 783 aa15.3■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.3■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.3■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.3■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.3■□□□□ 0.04
UBE2B-208ENST00000511807 COL24A1Q17RW2 1714 aa15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms