RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
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SH3BP2-208ENST00000504294 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 BRWD3Q6RI45 1802 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 SULT6B1Q6IMI4 303 aa19.46■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC37A3O60309 1634 aa19.45■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 ANP32CO43423 234 aa19.45■□□□□ 0.7
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SH3BP2-208ENST00000504294 NEFMP07197 916 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 BAG6P46379 1132 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 KDRP35968 1356 aa19.44■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 MEGF6O75095 1541 aa19.43■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 IFNL2Q8IZJ0 200 aa19.43■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM182BQ5T319 152 aa19.41■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 FCHSD2O94868 740 aa19.4■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM37O94972 964 aa19.4■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.4■□□□□ 0.7
SH3BP2-208ENST00000504294 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.4■□□□□ 0.7
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SH3BP2-208ENST00000504294 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 APBA3O96018 575 aa19.38■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 HMOX1P09601 288 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 GAS2L2Q8NHY3 880 aa19.37■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 RGPD1P0DJD0 1748 aa19.36■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 PLSCR1O15162 318 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 PHKG2P15735 406 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.35■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 AEBP1Q8IUX7 1158 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 DCAF5Q96JK2 942 aa19.35■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 CYP27B1O15528 508 aa19.34■□□□□ 0.69
SH3BP2-208ENST00000504294 PKD1L3Q7Z443 1732 aa19.33■□□□□ 0.68
SH3BP2-208ENST00000504294 ERVV-2B6SEH9 535 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-208ENST00000504294 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-208ENST00000504294 ACSBG1Q96GR2 724 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP2-208ENST00000504294 PRKAR2BP31323 418 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-208ENST00000504294 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-208ENST00000504294 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP2-208ENST00000504294 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP2-208ENST00000504294 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
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SH3BP2-208ENST00000504294 GNAT3A8MTJ3 354 aa19.27■□□□□ 0.68
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SH3BP2-208ENST00000504294 NHSQ6T4R5 1651 aa19.27■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 CABP4P57796 275 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 EP400Q96L91 3159 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 SBF2Q86WG5 1849 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 SHANK3Q9BYB0 1731 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 MAP3K5Q99683 1374 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 LMOD3Q0VAK6 560 aa19.22■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
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SH3BP2-208ENST00000504294 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa19.21■□□□□ 0.67
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SH3BP2-208ENST00000504294 TEFQ10587 303 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 PIGBQ92521 554 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 RUNDC1Q96C34 613 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 PLEKHF1Q96S99 279 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 MRS2Q9HD23 443 aa19.21■□□□□ 0.67
SH3BP2-208ENST00000504294 TXNRD1Q16881 649 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 PHACTR3Q96KR7 559 aa19.2■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 NFE2L2Q16236 605 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 DOT1LQ8TEK3 1739 aa19.19■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 PTF1AQ7RTS3 328 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.18■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.17■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 PALLDQ8WX93 1383 aa19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 LGR6Q9HBX8 967 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 STK32BQ9NY57 414 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 BTAF1O14981 1849 aa19.15■□□□□ 0.66
SH3BP2-208ENST00000504294 CCER2I3L3R5 266 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 TTC5Q8N0Z6 440 aa19.14■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 RIPK4P57078 832 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 IL17REQ8NFR9 667 aa19.13■□□□□ 0.65
SH3BP2-208ENST00000504294 ATG3Q9NT62 314 aa19.13■□□□□ 0.65
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