RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.74■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 DCCP43146 1447 aa20.74■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 C1orf167Q5SNV9 1468 aa20.74■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 PANK2Q9BZ23 570 aa20.73■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 DDIT3P35638 169 aa20.73■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 GBP4Q96PP9 640 aa20.73■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 AMPHP49418 695 aa20.72■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP20.72■□□□□ 0.91
SYP-208ENST00000494396 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
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SYP-208ENST00000494396 CADPS2Q86UW7 1296 aa20.68■□□□□ 0.9
SYP-208ENST00000494396 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
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SYP-208ENST00000494396 NFAT5O94916 1531 aa20.63■□□□□ 0.89
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SYP-208ENST00000494396 TNNQ9UQP3 1299 aa20.6■□□□□ 0.89
SYP-208ENST00000494396 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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SYP-208ENST00000494396 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.59■□□□□ 0.89
SYP-208ENST00000494396 IP6K1Q92551 441 aa20.59■□□□□ 0.89
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SYP-208ENST00000494396 SLIT3O75094 1523 aa20.58■□□□□ 0.89
SYP-208ENST00000494396 GCP02774 474 aa20.58■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 HS1BP3Q53T59 392 aa20.58■□□□□ 0.88
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SYP-208ENST00000494396 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 IFT57Q9NWB7 429 aa20.57■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 NPHP3Q7Z494 1330 aa20.57■□□□□ 0.88
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SYP-208ENST00000494396 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
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SYP-208ENST00000494396 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.55■□□□□ 0.88
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SYP-208ENST00000494396 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.55■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 MAP7D2Q96T17 732 aa20.55■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
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SYP-208ENST00000494396 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 ZNF428Q96B54 188 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 ALS2Q96Q42 1657 aa20.53■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 ARHGEF25Q86VW2 580 aa20.53■□□□□ 0.88
SYP-208ENST00000494396 ZBTB7CA1YPR0 619 aa20.52■□□□□ 0.88
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SYP-208ENST00000494396 OFD1O75665 1012 aa20.52■□□□□ 0.87
SYP-208ENST00000494396 KLHL40Q2TBA0 621 aa20.52■□□□□ 0.87
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