RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491572.1

UBE2Q1-206, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2Q1, Length 235 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-206ENST00000491572 PKNOX2Q96KN3 472 aa9.78□□□□□ -0.84
UBE2Q1-206ENST00000491572 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa9.78□□□□□ -0.84
UBE2Q1-206ENST00000491572 ABCA3Q99758 1704 aa9.77□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 TNS2Q63HR2 1409 aa9.77□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 WDR63Q8IWG1 891 aa9.77□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 MYH16Q9H6N6 1097 aa9.77□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 GRIN3BO60391 1043 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 CHGAP10645 457 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 CCDC27Q2M243 656 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 TBC1D2Q9BYX2 928 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 BTG4Q9NY30 223 aa9.76□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 IGHDP01880 384 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 SNX21Q969T3 373 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.75□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 WDR90Q96KV7 1748 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 PLSCR1O15162 318 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 TRAK2O60296 914 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 SKAP1Q86WV1 359 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 MAP7D2Q96T17 732 aa9.74□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 ESPNB1AK53 854 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 KIF3CO14782 793 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 CANXP27824 592 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 GBP4Q96PP9 640 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 PDCL3Q9H2J4 239 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9.73□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 KIF1AQ12756 1690 aa9.72□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 APAF1O14727 1248 aa9.72□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 HS1BP3Q53T59 392 aa9.72□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 CFAP44Q96MT7 982 aa9.72□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.72□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 KIF16BQ96L93 1317 aa9.72□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 ARHGEF10O15013 1369 aa9.72□□□□□ -0.85
UBE2Q1-206ENST00000491572 BCAR3O75815 825 aa9.71□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 HSCBQ8IWL3 235 aa9.71□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 WWC1Q8IX03 1113 aa9.71□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 C22orf23Q9BZE7 217 aa9.71□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.71□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 SEC24BO95487 1268 aa9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 RARSP54136 660 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 CCDC173Q0VFZ6 552 aa9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 RGL3Q3MIN7 710 aa9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 SMC5Q8IY18 1101 aa9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 RUNDC1Q96C34 613 aa9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 STK32BQ9NY57 414 aa9.7□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 SBNO1A3KN83 1393 aa9.69□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 TOMM70O94826 608 aa9.69□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP9.69□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 DDIT3P35638 169 aa9.69□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 SLC15A2Q16348 729 aa9.69□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 KRT28Q7Z3Y7 464 aa9.69□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 PPP1R9BQ96SB3 815 aa9.69□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.68□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 COG6Q9Y2V7 657 aa9.68□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 PSME1Q06323 249 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 MVPQ14764 893 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 BARGINQ6ZT62 677 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZMYND15Q9H091 742 aa9.67□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 NSD2O96028 1365 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 PROM2Q8N271 834 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 PANK1Q8TE04 598 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 DDX19BQ9UMR2 479 aa9.66□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 TECPR2O15040 1411 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 OVOS2Q6IE36 1432 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 IL16Q14005 1332 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 OFD1O75665 1012 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 MCM5P33992 734 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 KLHL34Q8N239 644 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 NLGN2Q8NFZ4 835 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 ZNF428Q96B54 188 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 CFAP53Q96M91 514 aa9.65□□□□□ -0.86
UBE2Q1-206ENST00000491572 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms